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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000075`

染色体: Chr04 坐标: 694750-696481 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000075`
名称	SmilChr04G000075
描述	uncharacterized SmilChr04G000075
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	694750 - 696481 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022002`
GeneID	`131022002`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022002`
原始查询	`SmilChr04G000075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsSTA129; symbol=OsSTA129; hit=Os04g0552400; species=rice; confidence=medium
产物	OsSTA129; symbol=OsSTA129; hit=Os04g0552400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G02040` (AT1G02040) C2H2-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839284] identity=40.7; qcov=0.415; evalue=1.12e-30; confidence=low
Rice	`Os04g0552400` (OsSTA129) - identity=35; qcov=1.15; evalue=2.06e-67; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12874 (zf-met); PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022002

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807328.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807328.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807328.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807328.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807328.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:694975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr4:695075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:695276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B82
`Chr4:695366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:695379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C31
`Chr4:695490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B85,C29,D2
`Chr4:695498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B126,B127,B97
`Chr4:695516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:695572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:695574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:695975`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A6,B117,B21,B30,C20,C74
`Chr4:696056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807328.1

479 aa

240

479

zf-C2H2_6

zf-met

zf-C2H2_6

PF13912 zf-C2H2_6 28-50 aa PF12874 zf-met 224-247 aa PF13912 zf-C2H2_6 224-248 aa PF13912 zf-C2H2_6 301-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807328.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	28	50	4.9e-25	87.6	C2H2-type zinc finger
`XP_057807328.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	224	247	3.1e-07	31.2	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057807328.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	224	248	4.9e-25	87.6	C2H2-type zinc finger
`XP_057807328.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	301	325	4.9e-25	87.6	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951345.1
AAAGTCTCACTTACATACATATATATTATTACACTATCCTATTTTCCTCCCCAGCCCTCCTTAAAAAAGAAAACAGTTAATCCATCTAAAAACTAGGAGTGATCATTCTTCTTCACCATTTATTCCCACAACAACTTCACCTACAAGAACTAACTCCCCCACCTCCATCCATCCGAATTCATGCACCTATGTTTTTCCTCTGTTTTGGGAGTACTCTAATCTTGGCATTCATGGCCTCCTGCGTGAACGAGCAGGCCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022002
ATGTTTTTCCTCTGTTTTGGGAGTACTCTAATCTTGGCATTCATGGCCTCCTGCGTGAACGAGCAGGCCCCCAGTTTCAAGCACTACTGCAGGGTCTGCAAGAAGGGTTTCATGTGCGGGAGAGCCCTCGGCGGCCACATGCGGGCCCACGGCATCGGCGACGACAACGGCAACCTCGACGACGACGACAACGCCAGCGATTGGGAGGAGAAGTTCGGCAACAACAGCAACACCAGCAGCAAGCGGATGTACCAGCTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807328.1
MFFLCFGSTLILAFMASCVNEQAPSFKHYCRVCKKGFMCGRALGGHMRAHGIGDDNGNLDDDDNASDWEEKFGNNSNTSSKRMYQLRTNPNRLKSCRTCENCGKEFLSWKSFLEHGNGKCASDDAASESLVVSSEDGDDDVVGGGGRRWSKRKRSLRSAYATTSEEDDLLLATCLMQLANTTVELEPEESCASASKEEGRYHNAGPAPAPAPAPLKSRAKGGLFECKACKKVFNSHQALGGHRASHKKVKGCFAAKQDEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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