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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000079`

染色体: Chr04 坐标: 718781-719961 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000079`
名称	SmilChr04G000079
描述	SPX domain-containing protein 3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	718781 - 719961 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022006`
GeneID	`131022006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022006`
原始查询	`SmilChr04G000079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SPX domain-containing protein 3
产物	SPX domain-containing protein 3
Arabidopsis	`AT2G45130` (SPX3) SPX domain protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819120] identity=63.5; qcov=1.03; evalue=1.01e-104; confidence=high
Rice	`Os10g0392600` (OsSPX3) - identity=56.3; qcov=1.04; evalue=1.78e-93; confidence=high
GO	GO:0016036 (cellular response to phosphate starvation)
KEGG	-
Pfam	PF03105 (SPX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807332.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807332.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057807332.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057807332.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:719061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B73,B74,C47,C78
`Chr4:719067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr4:719370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr4:719443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr4:719457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C71
`Chr4:719524`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B18,B31,B50,B59,C20,C36,C56
`Chr4:719525`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A18,B117,B131,B136,B140,B28,B4,B51,B57,B64,B66,B73,B76,B90,C19,C2,C38,C64,C79,C80,C82,D6
`Chr4:719610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807332.1

252 aa

126

252

SPX

PF03105 SPX 1-37 aa PF03105 SPX 108-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807332.1`	Pfam	`PF03105`	SPX	Domain	1	37	4.9e-25	90.0	SPX domain
`XP_057807332.1`	Pfam	`PF03105`	SPX	Domain	108	158	4.9e-25	90.0	SPX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951349.1
GGGAATTCAGAGGCCTTCTATACCTTTTTTTAAACGCCACTTCATCACGCCAAGCATATGCTCTCTAGATATTCTATCCTTTTCAAATAAAGCCACCTAATTCCCTTCTTCACGCACACACACACGCAGAGGAAATCTCGATCGATCATGAAGTTTGGGAAGAGATTGAAGCAGCAGACAGAGGAGAGTCTGCCGGAGTGGCGGGATAAGTACTTGTCGTACAAGAGGCTGAAGAAGCTGGTGAAATTGATCTCGTCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022006
ATGAAGTTTGGGAAGAGATTGAAGCAGCAGACAGAGGAGAGTCTGCCGGAGTGGCGGGATAAGTACTTGTCGTACAAGAGGCTGAAGAAGCTGGTGAAATTGATCTCGTCGTCGGCGAATGGATCGCGGCACTGCGGCGGGGCGGAGGCGGAGTTCGTGTATTTGCTCAACGCTGAGATCGACAAGTTCAATGCCTTCTTCATCGAGCAGGAAGAGGATTTCGTCATTCGCCATAAGGAATTGCCGCATAGAATAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807332.1
MKFGKRLKQQTEESLPEWRDKYLSYKRLKKLVKLISSSANGSRHCGGAEAEFVYLLNAEIDKFNAFFIEQEEDFVIRHKELPHRIKKVMEKWGPNGSDASEAEFTEQMGRIRKDMVNFHGEMVLLMNYSNINYTGLAKILKKYDKRSGGVMRLPFIQKVLQQPFFTTDLISKLVKECQTTIESVFPPSVAFPDREVAVPGDGIFRNTVAALLTMQEMRRGSSTYSHFSLPPLNMPDIDVIHSLQLLTPIQIP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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