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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000113`

染色体: Chr04 坐标: 980419-983745 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000113`
名称	SmilChr04G000113
描述	probable protein S-acyltransferase 14
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	980419 - 983745 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022043`
GeneID	`131022043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022043`
原始查询	`SmilChr04G000113`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein S-acyltransferase 14
产物	probable protein S-acyltransferase 14
Arabidopsis	`AT3G60800` (AT3G60800) DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825251] identity=82; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0804300` - identity=74.7; qcov=1.04; evalue=1.61e-153; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0018230 (peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation); GO:0019706 (protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01529 (DHHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057807396.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057807396.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807396.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807396.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807396.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:980799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:982094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C21
`Chr4:982302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr4:983284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:983382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807396.1

304 aa

152

304

DHHC

PF01529 DHHC 119-245 aa

XP_057807397.1

297 aa

148

297

DHHC

PF01529 DHHC 112-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807396.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	119	245	2.6e-38	131.8	DHHC palmitoyltransferase
`XP_057807397.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	112	238	2.4e-38	131.9	DHHC palmitoyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951413.1
ACAAATTTTGTAGCTTTTACCTCGAAAAAGAATGAAATTATAAAATCGCCCCGCTAATTTCTCTCTCATCACTTCTCTCTCTATTTCACGCATGGATTCCATTTCCACCGTAGCTGGACTCATACTCATCAGGCGGAATCCATAAACCCTAACCACACCCCCCAAAAAACGCAAATTCGGAAGCTCAAATCACCGAATTGTAATCCCGCCTTCTGTTTCCTGTAGCTAATTTAGATTTGGTAATCGAGTAATCAAACAAT...

XM_057951414.1
CTCGAAAAAGAATGAAATTATAAAATCGCCCCGCTAATTTCTCTCTCATCACTTCTCTCTCTATTTCACGCATGGATTCCATTTCCACCGTAGCTGGACTCATACTCATCAGGCGGAATCCATAAACCCTAACCACACCCCCCAAAAAACGCAAATTCGGAAGCTCAAATCACCGAATTATCTGGTGCTGTGATGGCGTGGAACGTGTTCAAGTTCTGTACGGCGCTGCGGGGGCTCGGCTCGATCATGATTTTACTGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022043
ATGTATAGATCTGGTGCTGTGATGGCGTGGAACGTGTTCAAGTTCTGTACGGCGCTGCGGGGGCTCGGCTCGATCATGATTTTACTGGTTCTCGGCGTCGTCGGCGTCAGCTATTACGCGGTGGTGATCACCAATTACGGCCCTGGACTCGCTGCCGGCGGCCTCGATTCACTCGTCGCTTTCGTCGTCCTCACGTTGTTCCATTTTCTGTTGGTGATGCTGTTATGGAGTTATTTTTCAGTTGTCTTTACGGACCCAGG...

LOC131022043
ATGGCGTGGAACGTGTTCAAGTTCTGTACGGCGCTGCGGGGGCTCGGCTCGATCATGATTTTACTGGTTCTCGGCGTCGTCGGCGTCAGCTATTACGCGGTGGTGATCACCAATTACGGCCCTGGACTCGCTGCCGGCGGCCTCGATTCACTCGTCGCTTTCGTCGTCCTCACGTTGTTCCATTTTCTGTTGGTGATGCTGTTATGGAGTTATTTTTCAGTTGTCTTTACGGACCCAGGCACTGTGCCTCCGAATTGGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807396.1
MYRSGAVMAWNVFKFCTALRGLGSIMILLVLGVVGVSYYAVVITNYGPGLAAGGLDSLVAFVVLTLFHFLLVMLLWSYFSVVFTDPGTVPPNWRPAADEERGDNDPLTASEFPPDTENGRIRFCRKCNQLKPPRCHHCSVCGRCVLKMDHHCVWVVNCVGALNYKNFLLFLFYTFLETSLVTLSLLPHFIAFFSDGEIPGTPGTLATTFLAFVLNLAFALSVMGFLIMHISLVAANTTTIEAYEKKSSPKWRYDLGRKRN...

XP_057807397.1
MAWNVFKFCTALRGLGSIMILLVLGVVGVSYYAVVITNYGPGLAAGGLDSLVAFVVLTLFHFLLVMLLWSYFSVVFTDPGTVPPNWRPAADEERGDNDPLTASEFPPDTENGRIRFCRKCNQLKPPRCHHCSVCGRCVLKMDHHCVWVVNCVGALNYKNFLLFLFYTFLETSLVTLSLLPHFIAFFSDGEIPGTPGTLATTFLAFVLNLAFALSVMGFLIMHISLVAANTTTIEAYEKKSSPKWRYDLGRKRNFEQVFGM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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