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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000115`

染色体: Chr04 坐标: 1000348-1003600 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000115`
名称	SmilChr04G000115
描述	vestitone reductase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1000348 - 1003600 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022045`
GeneID	`131022045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022045`
原始查询	`SmilChr04G000115`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vestitone reductase
产物	vestitone reductase
Arabidopsis	`AT2G45400` (BEN1) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819146] identity=47.3; qcov=1.01; evalue=8.43e-105; confidence=high
Rice	`Os08g0515900` - identity=38.5; qcov=0.903; evalue=5.93e-61; confidence=medium
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF07993 (NAD_binding_4); PF13460 (NAD_binding_10); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807398.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807398.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807398.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807398.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1001637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:1003206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807398.1

331 aa

166

331

Epimerase

GDP_Man_Dehyd

3Beta_HSD

NAD_binding_4

NAD_binding_10

PF01370 Epimerase 9-253 aa PF16363 GDP_Man_Dehyd 11-87 aa PF01073 3Beta_HSD 11-179 aa PF07993 NAD_binding_4 11-199 aa PF13460 NAD_binding_10 13-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807398.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	9	253	3.1e-20	73.3	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057807398.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	11	87	2.9e-08	34.3	GDP-mannose 4,6 dehydratase
`XP_057807398.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	11	179	5.2e-12	46.1	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057807398.1`	Pfam	`PF07993`	NAD_binding_4	Family	11	199	2.7e-10	40.6	Male sterility protein
`XP_057807398.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	13	134	1.5e-08	35.4	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951415.1
TGCATCATATTCTCATTAGATAAATTAAGCAAGTTGAGAAAATGAATGCATAAATATCTTCTGCCGGAGATTAATTAATTATCCAAGAGCAAAAGACAGGAATGCCCTTCAACTTGCCATTATTTAAACAGACATGCATGGCTTCGTTTCTCTCACAAGTTACATCGATATATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGATGGTGAATGAAAATGGGAAAAAGGTATGTGTGACTGGAGGAACTGGTTTTCTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022045
ATGGTGAATGAAAATGGGAAAAAGGTATGTGTGACTGGAGGAACTGGTTTTCTTGGATCATGGATGATCAAGAGGCTACTCGAAGATGGCTACGCCGTCAACGCCACTGTCAGGCTCGATCCAGAGCGGAAGAGGGACATTAGCTACATCACCAACCTCCCCGGCGCGGCGGAGCGGTTGCAGATCTTCAACGCGGATCTCGACAAGCCGGAGACGTTCGCCCCGGCGATCGAGGGCTGCGGCGGCGTCTTCCACACGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807398.1
MVNENGKKVCVTGGTGFLGSWMIKRLLEDGYAVNATVRLDPERKRDISYITNLPGAAERLQIFNADLDKPETFAPAIEGCGGVFHTAHPLDFAEKETEEVKLKRVTTALRGILQACADCKTVRRVVYTASISSAAFDPANSGGKLIDEDSWTDVDFIRSLKTFGGPYIVTKALAEKAAIDLAAELGLDLVSLIPTWITGPFICPNFPDSVYVSLALILGDEGHYQHLKESSLVHVDDVARAHIHLLEYPDAKGRYITAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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