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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000122`

染色体: Chr04 坐标: 1045192-1049319 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000122`
名称	SmilChr04G000122
描述	protein cornichon homolog 4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1045192 - 1049319 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022051`
GeneID	`131022051`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022051`
原始查询	`SmilChr04G000122`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein cornichon homolog 4-like
产物	protein cornichon homolog 4-like
Arabidopsis	`AT1G12390` (AT1G12390) Cornichon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837794] identity=67.3; qcov=0.965; evalue=2.42e-54; confidence=high
Rice	`Os12g0506400` (OsCNIH2) - identity=55.2; qcov=0.921; evalue=4.14e-37; confidence=medium
GO	GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03311 (Cornichon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022051

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057807406.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057807406.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057807406.1`
4	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	0.20000	`XP_057807406.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057807406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1046373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A2,B122,B71,B82
`Chr4:1046373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,B71,B82
`Chr4:1046429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:1046460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B104,B23,C58
`Chr4:1047448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B126,C13
`Chr4:1047479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr4:1047557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,D11
`Chr4:1047669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807406.1

134 aa

134

Cornichon

PF03311 Cornichon 5-125 aa

XP_057807407.1

134 aa

134

Cornichon

PF03311 Cornichon 5-125 aa

XP_057807408.1

114 aa

114

Cornichon

PF03311 Cornichon 5-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807406.1`	Pfam	`PF03311`	Cornichon	Family	5	125	1.5e-42	145.4	Cornichon protein
`XP_057807407.1`	Pfam	`PF03311`	Cornichon	Family	5	125	1.5e-42	145.4	Cornichon protein
`XP_057807408.1`	Pfam	`PF03311`	Cornichon	Family	5	109	3.4e-40	137.8	Cornichon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101137.1
GTCAAAGTCGTTTCCTTTAGCATACCTATCTGAGGGAGAGAGACACAGAGAGGAACGAGAGGCAGCAATGGCGGATTTATTTGCATGGCTAATTTCCTTCTTTCTCGTCATAGGTATTATTGGAATTATACTTTTCCAGCTAATGTGCTTGGCCGACCTTGAGTATGATTATATCAACCCATATGATTCAGCATCCCGAGTAAATAAGGCTGTTTTGCCAGAGTTTATTGCACAAGGAATTTTATGCCTTCTCCATCTTA...

XR_009101138.1
AAAGTCGTTTCCTTTAGCATACCTATCTGAGGGAGAGAGACACAGAGAGGAACGAGAGGCAGCAATGGCGGATTTATTTGCATGGCTAATTTCCTTCTTTCTCGTCATAGGTATTATTGGAATTATACTTTTCCAGCTAATGTGCTTGGCCGACCTTGAGTATGATTATATCAACCCATATGATTCAGCATCCCGAGTAAATAAGGCTGTTTTGCCAGAGTTTATTGCACAAGGAATTTTATGCCTTCTCCATCTTACAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022051
ATGGCGGATTTATTTGCATGGCTAATTTCCTTCTTTCTCGTCATAGGTATTATTGGAATTATACTTTTCCAGCTAATGTGCTTGGCCGACCTTGAGTATGATTATATCAACCCATATGATTCAGCATCCCGAGTAAATAAGGCTGTTTTGCCAGAGTTTATTGCACAAGGAATTTTATGCCTTCTCCATCTTACAACAGGACATTGGGTTATGTTTCTGCTCTGCCTACCATTTGCATATTACAATGTAACAATATATAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057807406.1
MADLFAWLISFFLVIGIIGIILFQLMCLADLEYDYINPYDSASRVNKAVLPEFIAQGILCLLHLTTGHWVMFLLCLPFAYYNVTIYTRRQHFVDVTEIFNQLPWEKKVRLFKLGYLVIFLALTIFLMIWSIVDE

XP_057807407.1
MADLFAWLISFFLVIGIIGIILFQLMCLADLEYDYINPYDSASRVNKAVLPEFIAQGILCLLHLTTGHWVMFLLCLPFAYYNVTIYTRRQHFVDVTEIFNQLPWEKKVRLFKLGYLVIFLALTIFLMIWSIVDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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