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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000126`

染色体: Chr04 坐标: 1067777-1070957 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000126`
名称	SmilChr04G000126
描述	LOB domain-containing protein 19-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1067777 - 1070957 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022057`
GeneID	`131022057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022057`
原始查询	`SmilChr04G000126`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 19-like
产物	LOB domain-containing protein 19-like
Arabidopsis	`AT2G45410` (LBD19) LOB domain-containing protein 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819149] identity=59.8; qcov=0.934; evalue=3.06e-66; confidence=high
Rice	`Os03g0246900` - identity=80.2; qcov=0.586; evalue=2.07e-57; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009755 (hormone-mediated signaling pathway); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807416.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807416.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807416.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807416.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807416.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1068035`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B60
`Chr4:1068035`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B60
`Chr4:1068073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:1068081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C87
`Chr4:1068162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C13
`Chr4:1070663`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr4:1070663`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807416.1

181 aa

181

LOB

PF03195 LOB 15-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807416.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	15	113	8.9e-35	119.9	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951433.1
ATTATTTTTTATCATCTAAACAAAAGATTTATCTAATTGAGAAGAAACATAAAGCAATGAGCTGCGACAGAGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGGCCTTGTGGTGCGTGCAAGTTTCTTCGACGTAAGTGCGTGAAAGGGTGCGTGTTTGCACCGTATTTCGACTCTGATCAGGGCACCGCCCACTTCGCCGCCGTGCACAGGGTGTTCGGAGCCAGCAACGCCTCCAAATTGCTGCTGAGAATTCCGCCGCACTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022057
ATGAGCTGCGACAGAGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGGCCTTGTGGTGCGTGCAAGTTTCTTCGACGTAAGTGCGTGAAAGGGTGCGTGTTTGCACCGTATTTCGACTCTGATCAGGGCACCGCCCACTTCGCCGCCGTGCACAGGGTGTTCGGAGCCAGCAACGCCTCCAAATTGCTGCTGAGAATTCCGCCGCACTGCCGCCTCGACGCCGTCGTCACGCTTTGTTACGAGGCGCTGGCTAGGGTTAGGGATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807416.1
MSCDRGGGGGGGGGPCGACKFLRRKCVKGCVFAPYFDSDQGTAHFAAVHRVFGASNASKLLLRIPPHCRLDAVVTLCYEALARVRDPVYGCAAHIFTLQQQVVNLQAELAYTQARISTLQCGPSLPILSSVADASPSSVDMVSFCSSVDQEVEDDGDLQSLAREYVSRYFPGVRFMPPTPH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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