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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000136`

染色体: Chr04 坐标: 1166012-1167714 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000136`
名称	SmilChr04G000136
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1166012 - 1167714 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022066`
GeneID	`131022066`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022066`
原始查询	`SmilChr04G000136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
产物	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G03940` (AT1G03940) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839366] identity=33.6; qcov=1.02; evalue=3.67e-82; confidence=low
Rice	`Os02g0820400` - identity=32.2; qcov=1; evalue=7.74e-66; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022066

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807429.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807429.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807429.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807429.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1166245`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B43,B48,B59,B74,B80,B89,B96,C70,C77,C86,D11
`Chr4:1166352`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A23,A6,B28
`Chr4:1166352`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A23,A6,B28
`Chr4:1166364`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	39	A22,A23,A4,B109,B128,B14,B17,B21,B28,B43,B46,B48,B50,B52,B59,B63,B72,B73,B79,B8,B80,B83,B84,B89,B90,B96,C5,C61,C70,C71,C72,C77,C84,C86,C87,D10,D11,D2,D5
`Chr4:1166436`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A11,A14,A4,A7,B11,B117,B12,B121,B128,B13,B131,B17,B21,B3,B32,B41,B43,B45,B46,B48,B52,B56,B59,B63,B65,B67,B72,B73,B79,B8,B80,B84,B88,B89,B90,B96,C15,C16,C27,C33,C70,C71,C77,C8,C84,C86,C87,D11,D5
`Chr4:1166444`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	51	A11,A14,A4,A7,B109,B11,B117,B12,B121,B128,B131,B17,B21,B32,B41,B43,B45,B46,B48,B52,B56,B59,B63,B64,B65,B67,B72,B73,B79,B8,B80,B82,B84,B88,B89,B90,B96,C15,C16,C27,C33,C53,C55,C70,C77,C8,C84,C86,C87,D11,D5
`Chr4:1166500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A11,A14,A4,A7,B109,B11,B117,B121,B128,B2,B21,B24,B32,B37,B41,B43,B45,B46,B48,B50,B56,B58,B59,B6,B63,B65,B67,B72,B73,B78,B79,B8,B80,B84,B88,B89,B90,B96,C15,C16,C18,C27,C53,C55,C60,C70,C71,C77,C8,C84,C86,C87,D10,D11,D5
`Chr4:1166609`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B48,B50,B58,C84
`Chr4:1166609`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B48,B50,B58,C84
`Chr4:1166618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B58,C84
`Chr4:1166624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B58
`Chr4:1166630`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807429.1

459 aa

230

459

Transferase

PF02458 Transferase 23-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807429.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	23	453	2.1e-41	142.8	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951446.1
ATTCACAGTTTATTTTTTATCTCTCGTTTGTTTATAAGAAATCGTGATCTAATCTCATCTTCTTCAGCAACTCAAAACTGCACGAGAGTTTTTACCAAGAAGAGAGATAGGCATCAGAATCCATGGCCGCCACCGCCACCATCCTCGAGCGCTGCCGTGTCGCGCCACCACTCGAAGGCGCCGCAGCGGCGGAGCAAATACTTCCTCTCACGTTTTTTGATATGCCATGGCTGTACTTCCATCCAATCCACCGCCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022066
ATGGCCGCCACCGCCACCATCCTCGAGCGCTGCCGTGTCGCGCCACCACTCGAAGGCGCCGCAGCGGCGGAGCAAATACTTCCTCTCACGTTTTTTGATATGCCATGGCTGTACTTCCATCCAATCCACCGCCTTCTCTTCTACAAATTCCCCTGCTCCAAAACTCATTTCCTCGAAACAATTGTGCCAAATTTCAAATATTCTCTTTCCCAAACACTCAAACACTTTTTTCCAGTTGCAGGCAGCTGCATCTATCCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807429.1
MAATATILERCRVAPPLEGAAAAEQILPLTFFDMPWLYFHPIHRLLFYKFPCSKTHFLETIVPNFKYSLSQTLKHFFPVAGSCIYPLNSEKIPELRYVPGDSVSVTIAEASEAHDLNRLTGNQPRVADEFYAFFSELPQPERSPESEFDKIPLFTAQITLFPDAGVCVGFNNHHIVGDASSIVSFIKAWCSVAKLGSDDEFSSSSDSLPLYDRSVVSDQSGLLNHYWNQMSTSKVLSLPLKFPLNKVRATYILQKRDVQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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