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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000138`

染色体: Chr04 坐标: 1179164-1185718 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000138`
名称	SmilChr04G000138
描述	uncharacterized SmilChr04G000138
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1179164 - 1185718 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022067`
GeneID	`131022067`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022067`
原始查询	`SmilChr04G000138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839310]; symbol=AT1G01930; hit=AT1G01930; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc finger protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839310]; symbol=AT1G01930; hit=AT1G01930; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G01930` (AT1G01930) zinc finger protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839310] identity=55.9; qcov=0.783; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0574600` - identity=46.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0030433 (GO:0030433)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF18716 (VATC); PF18826 (bVLRF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022067

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807430.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807430.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057807430.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807430.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807430.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1179461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A11,A9,B70,B73,C3
`Chr4:1179461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A9,B70,B73,C3
`Chr4:1179471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B57,C14,C35,C43
`Chr4:1179476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B57,C14,C35,C43
`Chr4:1179792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:1181099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B35,C82
`Chr4:1181202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:1181224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:1181240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:1181305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr4:1181391`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A11,A23,B10,B103,B107,B119,B12,B125,B13,B135,B14,B3,B55,B61,B67,B69,B70,B72,B8,C21,C31,C33,C43,C62,C71
`Chr4:1181476`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A11,A23,B10,B103,B107,B119,B12,B125,B13,B135,B14,B3,B55,B61,B67,B69,B70,B72,C21,C31,C33,C43,C62,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807430.1

681 aa

340

681

bVLRF1

Ank

VATC

PF18826 bVLRF1 247-383 aa PF00023 Ank 449-477 aa PF18716 VATC 645-676 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807430.1`	Pfam	`PF18826`	bVLRF1	Domain	247	383	5.1e-47	160.2	Bacteroidetes VLRF1 release factor
`XP_057807430.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	449	477	0.00027	21.8	Ankyrin repeat
`XP_057807430.1`	Pfam	`PF18716`	VATC	Domain	645	676	1.4e-08	35.1	Vms1-associating treble clef domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951447.1
AACACTTTTTACATATGGGTATAAATAGCCAGCCCCTTGAAGAAATTGATATCAACGGCTCACAAAATTACCCTTTTCAATCAAGTATTAAAAGAGGCAAGTTATTTGATAGCCATGGCGAGCGACGCCGCCGCCAGTGATAAGGCGGCGAAACAGCTTCCGCGCAAGCAAAACAAGCCGGACCAGACGAAGCGACATCGTTCGATATTTGAACTCCCGCCGGACTTCTTCGATTCATGCCGCCTCTTTAACTCCACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022067
ATGGCGAGCGACGCCGCCGCCAGTGATAAGGCGGCGAAACAGCTTCCGCGCAAGCAAAACAAGCCGGACCAGACGAAGCGACATCGTTCGATATTTGAACTCCCGCCGGACTTCTTCGATTCATGCCGCCTCTTTAACTCCACCTCGTCTCCTTTATCGGATTTTGAAACTTCGCCGGATGATGACTTCGAAGAATCGAAATCGGAAAAAGAAGCTGCCGACACCAGCAATCATGATGGTAATGCTACTAACAGTGGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807430.1
MASDAAASDKAAKQLPRKQNKPDQTKRHRSIFELPPDFFDSCRLFNSTSSPLSDFETSPDDDFEESKSEKEAADTSNHDGNATNSGKIMQRWSCNTCKAEFESLQDQRYHFKSDLHRFNIKLSIAGKSIIKEEDFDEASSNSLSKDYDVSSISGSDDEDERETSILADRKHECGGLSKRKICVQLKDGEIVSVWKCLFLDESDSISYETDKPHFMDGAGVVYLTPREVIEKLRYILHEPRDNSRLRIILLARGGHFAGCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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