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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000139`

染色体: Chr04 坐标: 1188095-1189729 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000139`
名称	SmilChr04G000139
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 10
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1188095 - 1189729 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022069`
GeneID	`131022069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022069`
原始查询	`SmilChr04G000139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 10
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 10
Arabidopsis	`AT3G60900` (FLA10) FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825261] identity=56.8; qcov=0.986; evalue=9.35e-146; confidence=high
Rice	`Os04g0574200` (OsFLA1) - identity=59.5; qcov=0.8; evalue=2.01e-128; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057807432.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057807432.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057807432.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807432.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807432.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1188422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B26,B5
`Chr4:1188424`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C31
`Chr4:1188424`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C31
`Chr4:1188498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B34,B50,B52,C27
`Chr4:1188519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C13,C28,C9,D2
`Chr4:1188522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:1188563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D7
`Chr4:1188564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D7
`Chr4:1188577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B27,C3
`Chr4:1188624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B85
`Chr4:1188654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C23
`Chr4:1188723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807432.1

420 aa

210

420

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 190-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807432.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	190	320	3.1e-25	89.5	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951449.1
CGCAGATTGAGCATTCGAGGCTAGACGTTACCAGGCGAATTTATTTTAATTTTTATAAATAATAATATTGGAGTCAAACGGCTCCATATCCGACGTGGCACTCTGCACTACATAAAACCCCAATCTCTCTCACTCCACTCCACTCCACTCTCACCACAGCTCCAGCAATGGCCGCCTCCCTCCTCTCCCTGGCCGTCATCGCCCTCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCACCAACATCACCGAGATCCTCTCCGCCTTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022069
ATGGCCGCCTCCCTCCTCTCCCTGGCCGTCATCGCCCTCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCACCAACATCACCGAGATCCTCTCCGCCTTCCCCGAGTACAGCGAGTTCAACGCCCTCCTCACCAAGACCAAGCTCGCCGACGAGATCAACAGCCGCGAGCCCGTCACCGTCTGCGCCCTCCCCAACGGCGCCCTCTCCGCCGTCACCGGCAAATACCCCCTCGCCGTCGTCAAGAACGTCCTCGCCCTCCACGTCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807432.1
MAASLLSLAVIALLSAAAAATNITEILSAFPEYSEFNALLTKTKLADEINSREPVTVCALPNGALSAVTGKYPLAVVKNVLALHVLLDYFDGPKLHKISDGSVLSTTLYQTTGNAAAQLGFVNITDVKGGKVAFGSGVPGSPLDSTFTKSVKQFPYNLSVIELSKAIAPSAVLAAPAPSANLTALLDKAGCKTFASLIVSTGVAKVFASAADKGLTIFAPNDEAFKAADAPDLSKLTNAEVVSLLQYHALAAYSPVGSLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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