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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000154`

染色体: Chr04 坐标: 1349669-1350494 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000154`
名称	SmilChr04G000154
描述	agamous-like MADS-box protein AGL80
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1349669 - 1350494 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022084`
GeneID	`131022084`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022084`
原始查询	`SmilChr04G000154`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL80
产物	agamous-like MADS-box protein AGL80
Arabidopsis	`AT5G48670` (AGL80) AGAMOUS-like 80 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834925] identity=57.6; qcov=0.735; evalue=5.62e-57; confidence=high
Rice	`Os03g0582400` (MADS87) - identity=41.6; qcov=0.749; evalue=1.87e-38; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022084

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807458.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807458.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807458.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807458.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1349873`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	96	A14,A15,A18,A19,A2,A20,A25,A4,A5,A9,B103,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B124,B128,B131,B134,B135,B15,B16,B21,B22,B27,B29,B30,B31,B35,B36,B39,B4,B43,B44,B49,B56,B57,B58,B60,B69,B7,B74,B77,B79,B88,B89,B90,B92,B96,C10,C11,C14,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C39,C4,C40,C44,C5,C53,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C69,C72,C74,C76,C81,C82,C85,C86,D1,D11,D4,D7,D9
`Chr4:1349905`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A13,A15,A19,B109,B11,B27,B43,B44,B45,B56,B69,B7,B96,C31,C37,C40,C54,C63,C76,C79,D10
`Chr4:1349911`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B124,B26,C11,C29,C50,C69,C72,C8
`Chr4:1349942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B102,C4,C6
`Chr4:1350050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:1350161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B5,D6
`Chr4:1350233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B16,B5,D6
`Chr4:1350302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807458.1

215 aa

108

215

SRF-TF

PF00319 SRF-TF 11-51 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807458.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	11	51	8.6e-18	64.2	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951475.1
ACGTACACATATATATACACATCAAGAGCATATATATGATGATCACAATCATATCTGCAGCAAGAGAGAGATCGAGATGACTCGGAAGAAGGTGAAGCTGGCGTTCATCATCAACGACTCGGCGCGGAAGGCGACGTTCAAGAAGCGGAAGAAGGGGCTGCTGAAGAAGGTGAGCGAGCTGAGCACGCTGTGCGGGATCGAGTCGTGCGCCATCGTGTACAGCCCGTACGAGTCGGGCCCGGAGGTGTGGCCCGACGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022084
ATGACTCGGAAGAAGGTGAAGCTGGCGTTCATCATCAACGACTCGGCGCGGAAGGCGACGTTCAAGAAGCGGAAGAAGGGGCTGCTGAAGAAGGTGAGCGAGCTGAGCACGCTGTGCGGGATCGAGTCGTGCGCCATCGTGTACAGCCCGTACGAGTCGGGCCCGGAGGTGTGGCCCGACGCGGGCGGGGCGGGGCGCGTGGTGGCGCAGTTCAAGCGCATGCCGGAGATGGAGCAGAGCAAGAAGATGGTGAACCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807458.1
MTRKKVKLAFIINDSARKATFKKRKKGLLKKVSELSTLCGIESCAIVYSPYESGPEVWPDAGGAGRVVAQFKRMPEMEQSKKMVNQESFIRQRVAKAAEQLKKLHKDNREKEVTHLMYHCLAGKGLHGLPLPDLNDMAWLLDHNLKEIYKRIEGIKKQQQRSLDAGGGGEGQQQQQWVGEQPQQQMGGGFGEEMIVPFSDGSSHAAAMWSNLFFP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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