当前解析结果
SmilChr04G000158| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000158 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000158 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000158 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 1379306 - 1381985 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022089 |
|---|---|
| GeneID | 131022089 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022089 |
| 原始查询 | SmilChr04G000158 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022089 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057807463.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057807463.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057807463.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057807463.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807463.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:1379669 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr4:1379711 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B102,B132,C4 |
Chr4:1379810 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr4:1379846 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr4:1380142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr4:1380274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B67,C57,C82 |
Chr4:1380376 |
C |
CCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D5 |
Chr4:1380376 |
C |
CCT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | D5 |
Chr4:1380439 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C57 |
Chr4:1380471 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C57 |
Chr4:1380615 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,C1 |
Chr4:1380620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。