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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000159`

染色体: Chr04 坐标: 1384308-1388081 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000159`
名称	SmilChr04G000159
描述	uncharacterized SmilChr04G000159
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1384308 - 1388081 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022090`
GeneID	`131022090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022090`
原始查询	`SmilChr04G000159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=35.5; qcov=0.755; evalue=1.17e-164; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807466.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057807466.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807466.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807466.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1384750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,C80
`Chr4:1385062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr4:1385082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C49
`Chr4:1385108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:1385125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C17
`Chr4:1385130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,D9
`Chr4:1385165`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr4:1385165`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr4:1385185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:1385211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr4:1385320`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C49
`Chr4:1385320`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807466.1

1126 aa

563

1126

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF13963 Transpos_assoc 5-81 aa PF02992 Transposase_21 291-503 aa PF13960 DUF4218 687-800 aa PF13952 DUF4216 969-1042 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807466.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	81	3.8e-18	66.1	Transposase-associated domain
`XP_057807466.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	291	503	6.4e-79	264.8	Transposase family tnp2
`XP_057807466.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	687	800	2.5e-40	137.6	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057807466.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	969	1042	4.2e-17	63.2	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951483.1
CATGATTTTTATTGCTTTTATTTGTATTGTATTATTGCTTCGACATTGGGGGGCCGGGTAGACCTAGTATAGGCTTAGTAAATTAGGACCACTATGGTCACTATAGTTGCTGGTAGAGTCGAGCACTTGGTAGTTAGGATAGTGGGGTTATGCTGTCGAAATTTTGTTAGATTTCAAGTAATTTATTATATTTTATTTGTTTTTTTCAATTAGAATTTGCAAGAATGAGTGATAATCGTACGTGGATGTACGCGAGATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022090
ATGAGTGATAATCGTACGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTACCGCATTTGAAACGGGGCTTGAGTTTTTCCTTGAGTGGGCGTTCAATCAAACGGCGTACACAGATGGACAAGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAAGAAGTGCAAGAATCAAGCGTATTTAGATGTACCTACGGTCAGAAAACATGTTAGTAGGCGTGGATTTGTCCTGAATTACAAAGTTTGGGTTTGTCACGGGGAAGCACCGCTGTCTATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807466.1
MSDNRTWMYARYNDRTAFETGLEFFLEWAFNQTAYTDGQGNIRCPCKKCKNQAYLDVPTVRKHVSRRGFVLNYKVWVCHGEAPLSMPREHAIMNEDDGLYNNYERMVHDHAGPSNYQDPPNLEQPPNNDAQQIYNMLDASDTPLYAGCDTYTQLSWMTQFMSIKTESHMSERTYNQMSSMMKVALPEGNNCPEDFYSTKRNLRGLGLPVEKIDCCVNNCMLYWGETSELHSCMFCDQSRYKDSLRASGSRRKKQVPAKQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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