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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000163`

染色体: Chr04 坐标: 1463504-1468478 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000163`
名称	SmilChr04G000163
描述	pectin acetylesterase 12-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1463504 - 1468478 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022092`
GeneID	`131022092`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022092`
原始查询	`SmilChr04G000163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 12-like
产物	pectin acetylesterase 12-like
Arabidopsis	`AT3G05910` (AT3G05910) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819760] identity=66.2; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0634600` (P0455H11.118-1) - identity=63.6; qcov=0.88; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022092

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057807469.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057807469.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807469.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807469.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807469.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1463860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr4:1465006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B36,B99
`Chr4:1465031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B137,C51,D8
`Chr4:1465174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B29,B70,C34
`Chr4:1465907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A7,B123,B38,B39
`Chr4:1465956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B51,C21,C77
`Chr4:1466155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr4:1466165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C55
`Chr4:1466337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:1466508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:1467851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C58,D3
`Chr4:1467944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807469.1

425 aa

212

425

PAE

PF03283 PAE 58-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807469.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	58	420	6.9e-169	562.5	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951486.1
AATACTAATGAAATCTTTGTAATGAAACGCAAAAGTAGTTGCAAGACTCAATCCAACTGTCCACTGCCAAAAAAAACACACACACACACACACAAGAAGACGCTCTATGCCTTAGATCTGCAAATCTTCCAAGAAGTATATATGTAAAAAAAAAAAAAAGACATGGACAAAATTAATGACAACGAAAAAAGCATAAGTCGGCAGTCCGAGAAAACAGCAATGTCAATTTTCACACCTACAAAACCCAGATTCGTTTACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022092
ATGGAGAGCTCGACCGGCTTCTGGTTTGTGATTGCTGCTGCGATTTCTCTCTGCAAATGGGGAGTTGCAGGCTTTGAAGCTCGAGAGGTTTTCAGCGGGAATGTGTCGCTGTTGGAATCTCTGTCTTATTTGGAATCTGTGTATGGAATATCTGATGCTGCTGCTCCTCCCAATGCTCTCATGGTGCCTCTCACTCTTATCCATGGAGCTGCTGCTAAAGGAGCTGTGTGTCTAGATGGAACCTTACCCGGTTATCACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807469.1
MESSTGFWFVIAAAISLCKWGVAGFEAREVFSGNVSLLESLSYLESVYGISDAAAPPNALMVPLTLIHGAAAKGAVCLDGTLPGYHFHRGFGSGANSWLVNLEGGGWCNNIRTCVYRKKTRRGSSNYFERQIAFTGILSDKAWENPDFYNWNRVKIRYCDGASFSGQGENRAAGLQFRGQRIYQAAMDELMSMGMRNANQVLLAGCSAGGLAVILHCDRFRGLFPGSTKVKCLSDGGLFMDAPDVSGRHTLRNFFSGVVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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