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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000183`

染色体: Chr04 坐标: 1629005-1630468 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000183`
名称	SmilChr04G000183
描述	60S ribosomal protein L37a-1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1629005 - 1630468 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022113`
GeneID	`131022113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022113`
原始查询	`SmilChr04G000183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L37a-1
产物	60S ribosomal protein L37a-1
Arabidopsis	`AT3G60245` (AT3G60245) Zinc-binding ribosomal protein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825195] identity=95.6; qcov=0.989; evalue=6.77e-59; confidence=high
Rice	`Os01g0679700` - identity=94.6; qcov=1; evalue=1.06e-59; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01780 (Ribosomal_L37ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807497.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057807497.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807497.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807497.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1629196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B4
`Chr4:1629199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,C12,C36,D3
`Chr4:1629223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B107,B131,C13,C49
`Chr4:1629356`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A10,B108,B111,B120,B29,B30,B46,B91,C1,C23,C32,C39,C46,C68
`Chr4:1629361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C40
`Chr4:1629531`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A3,B110
`Chr4:1629531`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A3,B110
`Chr4:1629534`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A5,A9,B113,B13,B138,B3,B31,B71,B76,B89,C10,C3,C37,C54,C55,C59,C76,C80,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807497.1

92 aa

Ribosomal_L37ae

PF01780 Ribosomal_L37ae 4-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807497.1`	Pfam	`PF01780`	Ribosomal_L37ae	Family	4	88	3.3e-40	136.8	Ribosomal L37ae protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951514.1
AAGCAAAAACTTTGGGGAGGTAAATGCAATTTGGAGTATATACGTCTACATATAAGAGCATCGACAAGGGTTTCTTTTCTTTCACGCAGCTGAATCTAGGGTTTTTGACTTTCAGCAGCTGCTTCTCGTCGCGCCGGCCGTCTACCCATTTGCAATGGCCAAGAGAACCAAGAAGGTTGGGATCGTCGGGAAATATGGCACCCGGTATGGTGCTAGTTTGAGGAAGCAGATTAAAAAGATGGAGGTTAGCCAGCATAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022113
ATGGCCAAGAGAACCAAGAAGGTTGGGATCGTCGGGAAATATGGCACCCGGTATGGTGCTAGTTTGAGGAAGCAGATTAAAAAGATGGAGGTTAGCCAGCATAGCAAGTACTTCTGCGAGTTCTGCGGAAAGTACGCCGTGAAGAGAAAGGCAGTCGGCATTTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAAGTGAAAGCAGGCGGTGCTTACACCATGAACACTGCCAGTGCCGTGACCGTGAGGAGCACCATCAGAAGGCTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807497.1
MAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKQIKKMEVSQHSKYFCEFCGKYAVKRKAVGIWGCKDCGKVKAGGAYTMNTASAVTVRSTIRRLREATES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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