当前解析结果
SmilChr04G000186| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000186 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000186 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000186 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 1649188 - 1650871 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021111 |
|---|---|
| GeneID | 131021111 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021111 |
| 原始查询 | SmilChr04G000186 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=36; qcov=0.442; evalue=1.12e-41; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021111 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057806184.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057806184.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806184.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057806184.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057806184.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:1649265 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B126,C64 |
Chr4:1649331 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C20,D2 |
Chr4:1649371 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
Chr4:1649379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B10 |
Chr4:1649379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr4:1649443 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B123,B45,C67 |
Chr4:1649498 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B86,C50 |
Chr4:1649562 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B13,B131 |
Chr4:1649585 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
Chr4:1649587 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,C83 |
Chr4:1649589 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C19 |
Chr4:1649589 |
A |
AC |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C19 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。