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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000187`

染色体: Chr04 坐标: 1655077-1664720 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000187`
名称	SmilChr04G000187
描述	eukaryotic translation initiation factor 4G-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1655077 - 1664720 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022114`
GeneID	`131022114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022114`
原始查询	`SmilChr04G000187`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 4G-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 4G-like
Arabidopsis	`AT3G60240` (EIF4G) eukaryotic translation initiation factor 4G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825194] identity=44.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os07g0555200` (eIF4Gtsv1) - identity=42.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0016281 (eukaryotic translation initiation factor 4F complex)
KEGG	-
Pfam	PF02847 (MA3); PF02854 (MIF4G)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807498.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057807498.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057807498.1`
4	P-body	P-body	1.00000	`XP_057807498.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807498.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1655983`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A15,A2,B124,B133,B134,B137,B2,B24,B32,B34,B4,B41,B59,B79,B86,C14,C25,C42,C55,C63,C9
`Chr4:1655984`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A15,A2,B124,B133,B134,B137,B2,B24,B32,B34,B4,B41,B59,B79,B86,C14,C25,C42,C55,C63,C9
`Chr4:1656003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:1656504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B5
`Chr4:1656556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:1656558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr4:1657967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:1658373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B48,B67,C61,D7
`Chr4:1658575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B67,C61
`Chr4:1658886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:1659006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B3,B97,C53,D1
`Chr4:1659081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807498.1

1761 aa

880

1761

MIF4G

MA3

PF02854 MIF4G 1120-1343 aa PF02847 MA3 1574-1688 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807498.1`	Pfam	`PF02854`	MIF4G	Repeat	1120	1343	8e-50	170.1	MIF4G domain
`XP_057807498.1`	Pfam	`PF02847`	MA3	Repeat	1574	1688	1.5e-12	48.2	MA3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951515.1
CAATCCTCGTTTCAAATCTTAAATAATAATCAATAATATTATAGAAACAAAATTTACATGTGCACTACTATAAAACTCCACCTTTCTCTCTCTACTATACCCTTTTTCATCTCTTTAAACACAAAATCACTCACTTCTTTTCTTCCTTAGTTTCTTCCCGTTCGTCTTCATCCGCTGCTCTTACGGCGTCGTTCCGTCATGGTTCCCGCCATTGTTATATCCGAGTAGAAACCCTAATACCCCTCCACCCGCTCCAGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022114
ATGAACCAGAATCAATCAAGGGCTGAGAGGAGCGATTCTGCGCAGTACAGGAAAGCCGGCCGATCCGGCAGCTCCAATCAGCAGCGTCAGTACTCCGGTGGCGTTTCCACTAAGGGTGGTGGCGGCGCCTCCTCCGCCCCCACCAATCCTGCTAACCGCAGTTTTAAGAAGTATAACAACAATGCACCAGTAGCGCAGCCTGGAGCAGGACCATGGAATGTAGATTCTAGCGATTCATCTGCCGTTCATGCTGTACAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807498.1
MNQNQSRAERSDSAQYRKAGRSGSSNQQRQYSGGVSTKGGGGASSAPTNPANRSFKKYNNNAPVAQPGAGPWNVDSSDSSAVHAVQNGAHQQQPTQRVPEAPGSKISSNLKPTDASNLKATRPVPKSPSSNVSSAAASSNVTNASSDSKAPATPGKTSGDASKSFPLQFGSISPGFMNGMQIPARTSSAPPNLDEQKKDQARYESSRAAPALPTPSIPKQHFPKKDAGILDQPNSGEAHLASKPKRDVQISTAPPGIQAQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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