当前解析结果
SmilChr04G000192| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000192 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000192 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000192 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 1706246 - 1709809 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022118 |
|---|---|
| GeneID | 131022118 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022118 |
| 原始查询 | SmilChr04G000192 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022118 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807505.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057807505.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807505.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057807505.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057807505.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:1706576 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B128,B46,B90,B92 |
Chr4:1706588 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B124,B16,B88,C67 |
Chr4:1706657 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B8,B82,C73 |
Chr4:1706684 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B16,B17,B88,C8 |
Chr4:1706812 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B88,C22 |
Chr4:1706843 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B17,C8,D10 |
Chr4:1706888 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C22,C67,C76 |
Chr4:1707075 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B125,B75,B90,B92,C87 |
Chr4:1707093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,B65,C45 |
Chr4:1707109 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C45 |
Chr4:1707121 |
C |
CGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | C40,C47 |
Chr4:1707121 |
C |
CGG |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | C40,C47 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
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下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。