当前解析结果
SmilChr04G000193| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000193 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000193 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000193 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 1711053 - 1714727 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022119 |
|---|---|
| GeneID | 131022119 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022119 |
| 原始查询 | SmilChr04G000193 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022119 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807507.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057807507.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057807507.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807507.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057807507.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:1711415 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B82,C73 |
Chr4:1711593 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B60,C76 |
Chr4:1711594 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B60,C67,C76 |
Chr4:1711595 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B60,C76 |
Chr4:1711705 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr4:1711830 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B16,B83,C43,D7 |
Chr4:1712082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:1712147 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B124,B88 |
Chr4:1712163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 25 | A20,A4,A9,B110,B112,B114,B115,B120,B124,B136,B20,B21,B37,B54,B63,B73,B85,B88,C2,C21,C41,C46,C54,C78,C83 |
Chr4:1712229 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B124,B88 |
Chr4:1712263 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B124,B6,B88,C67 |
Chr4:1712270 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B124,B6,B88,C67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。