当前解析结果
SmilChr04G000220| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000220 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000220 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000220 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 1913754 - 1916737 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022149 |
|---|---|
| GeneID | 131022149 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022149 |
| 原始查询 | SmilChr04G000220 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022149 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807548.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057807548.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057807548.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057807548.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807548.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:1915239 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B65,B91,C47 |
Chr4:1915250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr4:1915276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,D11 |
Chr4:1915277 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B56,C10,C13 |
Chr4:1915281 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,C61 |
Chr4:1915285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr4:1915309 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A15,B63,B86,C52,C55 |
Chr4:1915309 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B63,B86,C52,C55 |
Chr4:1915314 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B53 |
Chr4:1915314 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr4:1915321 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr4:1915335 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C12,C77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。