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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000234`

染色体: Chr04 坐标: 2074561-2079892 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000234`
名称	SmilChr04G000234
描述	iron-sulfur assembly protein IscA-like 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2074561 - 2079892 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022161`
GeneID	`131022161`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022161`
原始查询	`SmilChr04G000234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	iron-sulfur assembly protein IscA-like 2, mitochondrial
产物	iron-sulfur assembly protein IscA-like 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G03905` (AT5G03905) Iron-sulfur cluster biosynthesis family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830270] identity=62.8; qcov=0.994; evalue=6.93e-65; confidence=high
Rice	`Os08g0369700` (OsISC10) - identity=62.3; qcov=0.981; evalue=5.15e-63; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding); GO:0106035 (GO:0106035)
KEGG	-
Pfam	PF01521 (Fe-S_biosyn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022161

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807566.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807566.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807566.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807566.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2074991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:2075024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C18,C44
`Chr4:2075718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	72	A10,A14,A15,A19,A2,A21,A22,A23,A3,A9,B106,B11,B111,B112,B118,B119,B122,B123,B127,B133,B135,B18,B19,B2,B32,B33,B39,B40,B43,B45,B47,B5,B50,B52,B55,B61,B63,B67,B72,B77,B86,B9,B93,B94,B96,C1,C12,C14,C15,C17,C21,C22,C25,C27,C37,C39,C40,C41,C51,C57,C58,C62,C66,C7,C70,C76,C77,C78,C80,C84,D1,D4
`Chr4:2075729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C78,D4
`Chr4:2075736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:2075773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr4:2075812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B58
`Chr4:2075814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A23,A8,B10,B101,B107,B110,B119,B12,B129,B130,B25,B36,B42,B43,B49,B51,B57,B64,B65,B66,B71,B76,B79,B89,B93,C13,C14,C16,C18,C21,C24,C26,C33,C36,C40,C55,C63,C64,C66,C77,C85,C9,D5
`Chr4:2075941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B58,C84,D10
`Chr4:2075963`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A20,B1,B113,B72,C22,C45,C78,C80
`Chr4:2075968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:2075973`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C47,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807566.1

157 aa

157

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 58-151 aa

XP_057807567.1

157 aa

157

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 58-151 aa

XP_057807568.1

157 aa

157

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 58-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807566.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	58	151	5.2e-13	49.9	Iron-sulphur cluster biosynthesis
`XP_057807567.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	58	151	5.2e-13	49.9	Iron-sulphur cluster biosynthesis
`XP_057807568.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	58	151	5.2e-13	49.9	Iron-sulphur cluster biosynthesis

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951585.1
TCGTGTATTAGTTAATTATATATTCCACCCTTCATTTCTCCCGACTTTCTTCTTCTTCCCCAAACCACGAACAAATACAATCTAGCAATAAGTTATCGACCATCCATTTATTTCTCTCATTCCTTTTCGGAGCCGAATCGTTCGAATTCCATTTTCAATTATTTTTCTGGAAAATCGTATCAGTTACTCTCCACAAAACATACGGCATGCTCGGTGGATTGGGTGCTGTAATCGGTTATCGTAGCTGTTATTTGCACGAT...

XM_057951584.1
ACCATCCATTTATTTCTCTCATTCCTTTTCGGAGCCGAATCGTTCGAATTCCATTTTCAATTATTTTTCTGGAAAATCGTATCAGTTACTCTCCACAAAACATACGGCATGCTCGGTGGATTGGGTGCTGTAATCGGTTATCGTAGCTGTTATTTGCACGATTGGAGCTGTAGATCTGTGGTAAAGTTGTAGACCTATTTTCAGAAATCAGTTTCTACAATTTGTAACAGATTTAACCGAATTCCACCACGCAACAAGGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022161
ATGACGATGTCTTCCAGCTCGTTAATCCGCCGTCTTGTGCCCTACTTTTCTGCTCAAATTCGTCGGAATTCTAGGCTTCTCAGTTCTTCCTCAGCTCTCCGCGAATCTGAGCTTTCTTCATCAGAATCTCCATCCCCCTCGACCGATGCCGTTCATTTGACCTACAACTGTGTTAGGCGAATGAAAGAGTTGCAAGCTGAAGAGTCCAGTAAGAAGTTGCTGCGCTTGAGCATAGAAGCTGGTGGTTGCTCTGGGTTTCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057807566.1
MTMSSSSLIRRLVPYFSAQIRRNSRLLSSSSALRESELSSSESPSPSTDAVHLTYNCVRRMKELQAEESSKKLLRLSIEAGGCSGFQYNFSLDDKTNNDDRIFEQDGVKLVVDNISFDFVKGATVDYVDELIRAAFQVSTNPSAVGGCSCKSSFMAK

XP_057807567.1
MTMSSSSLIRRLVPYFSAQIRRNSRLLSSSSALRESELSSSESPSPSTDAVHLTYNCVRRMKELQAEESSKKLLRLSIEAGGCSGFQYNFSLDDKTNNDDRIFEQDGVKLVVDNISFDFVKGATVDYVDELIRAAFQVSTNPSAVGGCSCKSSFMAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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