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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000239`

染色体: Chr04 坐标: 2142455-2143632 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000239`
名称	SmilChr04G000239
描述	agamous-like MADS-box protein AGL80
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2142455 - 2143632 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022166`
GeneID	`131022166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022166`
原始查询	`SmilChr04G000239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL80
产物	agamous-like MADS-box protein AGL80
Arabidopsis	`AT5G48670` (AGL80) AGAMOUS-like 80 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834925] identity=55.1; qcov=0.634; evalue=1.55e-49; confidence=medium
Rice	`Os03g0582400` (MADS87) - identity=35.4; qcov=0.642; evalue=3.01e-30; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807574.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807574.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807574.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807574.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807574.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2142977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:2143226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B17,B51
`Chr4:2143241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B138,B87,C78,D9
`Chr4:2143286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr4:2143410`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	104	A10,A13,A14,A15,A16,A21,A24,A25,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B109,B111,B113,B117,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B133,B135,B138,B140,B16,B20,B21,B22,B24,B26,B28,B3,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B42,B43,B50,B52,B54,B56,B59,B6,B60,B62,B65,B66,B7,B76,B77,B79,B85,B87,B90,B92,B93,B94,B96,C1,C11,C15,C16,C19,C2,C20,C25,C27,C36,C42,C45,C48,C49,C50,C56,C57,C62,C63,C66,C67,C69,C70,C71,C72,C76,C78,C79,C80,C82,C83,C84,C87,D10,D2,D3,D5,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807574.1

246 aa

123

246

SRF-TF

PF00319 SRF-TF 10-51 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807574.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	10	51	8.8e-18	64.2	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951591.1
CTGAATTTATTCCAAAAATCCAGACTATAGAGAAACAATACAACTAAGCATTAATTAAGATAAGAAAAGCGTTTCTCAAAATACTTGGCATCCAACGGTTGCAACAACTAAGACAACGCTAATGCACATTCAAATGCTTTAATCTCATATCATCAGCCATATATATAAATATATGAAGAAAATTGATTGATGAATAATCACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATGACGAGGAAGAAAGTAACATTGGCGTACATTAGCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022166
ATGACGAGGAAGAAAGTAACATTGGCGTACATTAGCAACGAGTCGGAGAGGAAAGCTTCATACAAGAAGCGGAAGAAGGGGCTGATGAAGAAGGTGAGCGAGCTGAGCACGCTATGCGGCGTGGACGCGTGCGCCATCGTCTACAGCCAATACGACGCCGTGCCGGAGGTGTGGCCGTCGCCGCTGGGGGCGCAGGCCATCCTCGCCCGCTTCCGCAAGCTCTCCGACATGGACCAGAGCCGCAAGATGGTCAACCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807574.1
MTRKKVTLAYISNESERKASYKKRKKGLMKKVSELSTLCGVDACAIVYSQYDAVPEVWPSPLGAQAILARFRKLSDMDQSRKMVNQESFTRQRIKKAADQLRRLQKENRCRELEALMFRCISGAAALDDFSLPDAAEMGWVISQTLRDINARMEAVAAADHRRRQPPPIAMPPPPPPPPDEVAEPHGLEECFPWNLVQSPSAGGGGGGGGFDGGGGLGWDAGMVLPYPYIFNHSNSTQTGHIHFNH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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