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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000240`

染色体: Chr04 坐标: 2148524-2149440 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000240`
名称	SmilChr04G000240
描述	uncharacterized SmilChr04G000240
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2148524 - 2149440 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021118`
GeneID	`131021118`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021118`
原始查询	`SmilChr04G000240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=41.2; qcov=0.261; evalue=9.37e-08; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=29; qcov=0.594; evalue=7.51e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021118

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057806191.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057806191.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057806191.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806191.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2148536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B20
`Chr4:2148538`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B113,B20
`Chr4:2148538`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B113,B20
`Chr4:2148541`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	66	A10,A3,A6,A7,B1,B108,B109,B112,B115,B120,B124,B125,B127,B129,B132,B133,B134,B136,B138,B140,B18,B21,B23,B25,B26,B33,B35,B46,B53,B55,B59,B61,B62,B68,B72,B80,B81,B82,B84,B87,B89,B95,C1,C14,C22,C25,C26,C33,C37,C4,C51,C55,C56,C57,C58,C59,C7,C73,C75,C77,C81,C82,C83,C9,D4,D7
`Chr4:2148543`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B26,C14
`Chr4:2148543`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B26,C14
`Chr4:2148545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:2148557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A3,B26,C14
`Chr4:2148562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B11,B21,C71
`Chr4:2148562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B21,C71
`Chr4:2148564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,C4,C78,C9,D2
`Chr4:2148568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806191.1

261 aa

130

261

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 119-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806191.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	119	210	1.7e-18	67.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950208.1
ATGGCTTTGGAGGTTTTTGGGGAAGGGGAAGCTCTGTGGGCGAGGGTGGTTAAATCTCTATATGGGGAGCTTGTGTGGGGGAAGAGGGGGAATGTTCGGTGGCGGGAAGAGGTGGGCAGAAAGGGTGGTGGCAGAAAATTGTGGATAGGGGAGGAGGGAGGGGCGATTAAAAGGCTGGTCGGTGAGAGCGGGTTTTGGGAGGGAGAGTTGTGGGTGTGGGCGGTGGAGTGGATGCGGGAGTTAAGGGAGAGGGAGAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021118
ATGGCTTTGGAGGTTTTTGGGGAAGGGGAAGCTCTGTGGGCGAGGGTGGTTAAATCTCTATATGGGGAGCTTGTGTGGGGGAAGAGGGGGAATGTTCGGTGGCGGGAAGAGGTGGGCAGAAAGGGTGGTGGCAGAAAATTGTGGATAGGGGAGGAGGGAGGGGCGATTAAAAGGCTGGTCGGTGAGAGCGGGTTTTGGGAGGGAGAGTTGTGGGTGTGGGCGGTGGAGTGGATGCGGGAGTTAAGGGAGAGGGAGAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806191.1
MALEVFGEGEALWARVVKSLYGELVWGKRGNVRWREEVGRKGGGRKLWIGEEGGAIKRLVGESGFWEGELWVWAVEWMRELREREKGQVEELLLVVSDFAPCTGLTEGWRWKATPDGFFTTKSAYDLLAATREEQQVQPLEMAKVWKAPTPHKAKVTAWRCLRNRLATCDNLRRINIQIGVEERWCNACVSSEETTEHLFLHCPKAAAVWDQIYQWLDIKTANPRSILQHFISFIAAGKRKKDRRLLKALWMGTVWLFWE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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