当前解析结果
SmilChr04G000242| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000242 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000242 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000242 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 2190371 - 2191768 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021120 |
|---|---|
| GeneID | 131021120 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021120 |
| 原始查询 | SmilChr04G000242 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003723 (RNA binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021120 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057806192.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057806192.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057806192.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057806192.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057806192.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:2190372 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B91 |
Chr4:2190372 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr4:2190386 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr4:2190395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B45,B48,C18,C59,C79 |
Chr4:2190396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B45,B48,C18,C59,C79 |
Chr4:2190407 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 22 | A10,A15,A2,B10,B134,B136,B138,B139,B50,B57,B76,B78,B89,C20,C21,C30,C51,C57,C66,C85,D1,D7 |
Chr4:2190419 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr4:2190428 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
Chr4:2190434 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:2190455 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr4:2190465 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr4:2190468 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B96,C4,C45,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。