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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000246`

染色体: Chr04 坐标: 2224786-2231203 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000246`
名称	SmilChr04G000246
描述	putative cyclic nucleotide-gated ion channel 8
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2224786 - 2231203 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022169`
GeneID	`131022169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022169`
原始查询	`SmilChr04G000246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative cyclic nucleotide-gated ion channel 8
产物	putative cyclic nucleotide-gated ion channel 8
Arabidopsis	`AT1G19780` (CNGC8) cyclic nucleotide gated channel 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838566] identity=65.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0646300` (OsCNGC6) - identity=60.2; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005249 (voltage-gated potassium channel activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006813 (potassium ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00027 (cNMP_binding); PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807580.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807580.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807580.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807580.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2225417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:2226428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B52
`Chr4:2227445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B29,B30,C36
`Chr4:2227585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B55,C17,C43
`Chr4:2230327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B52,C1,D10,D11
`Chr4:2230360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B111,B35
`Chr4:2230480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:2230489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2230543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:2230561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C71
`Chr4:2230591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2230597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807580.1

748 aa

374

748

Ion_trans

cNMP_binding

PF00520 Ion_trans 113-431 aa PF00027 cNMP_binding 525-615 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807580.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	113	431	2e-19	70.4	Ion transport protein
`XP_057807580.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	525	615	5.5e-08	33.4	Cyclic nucleotide-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951597.1
CCCAAAACTTATCATTATTTTTTACTCTAATATTCTGTTAATAATCTCATACAAACATCATTTTTTTCCGCGTGCATGCAGAGATAAGAGAAAATAATTGGACTTTTTGTTTTCAGATCAATTAGTCGGTGGCGTTGGGAGTTACATTTGCATTCTAGCATTGCAGGGATTTCTGGACACGGTATTTCATGATTCGTGCGCAAGATTAAGGGGTTCTTGTTTCTTTTCTGTTGAAAAGCTTAATGCAATTTGCTATGTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022169
ATGTTCGACCCCAATTACAAGACATATATTGGTGGCCAAAAGGAGAAATTTGTAAGATTGGAAGGCCCGGACTCTTTTAGATCAGAAATGGCTCAAAAGAATAGATGTGGATTTAGCTTAGAGGGTTTTGTCAACTCAAGGGCCTACGACTACAAATACATCAAAGTCATTAAAATGGTTCAACGGGGATCTGAAGGACTTCTTACATTTGGTCGGTCACTAAAATCCGGAGTCACAAAAGCAGTATTCCCAGAGGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807580.1
MFDPNYKTXYIGGQKEKFVRLEGPDSFRSEMAQKNRCGFSLEGFVNSRAYDYKYIKVIKMVQRGSEGLLTFGRSLKSGVTKAVFPEDLKVSERRIFDPQDKSLLFWNKLLVISCIFAVSVDPLFLYLPVFQPDKMCLHIHDSLAYTTTTLRTVIDVFYFARILLQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPKEIATRNIHRYFFVDLFSVLPLPQVVVWRFLHGAEDYDVLGTKQALVIIVFVQYIPRFLRFVPLTSELKKSQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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