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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000251`

染色体: Chr04 坐标: 2288499-2291230 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000251`
名称	SmilChr04G000251
描述	uncharacterized SmilChr04G000251
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2288499 - 2291230 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022175`
GeneID	`131022175`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022175`
原始查询	`SmilChr04G000251`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carboxyl-terminal peptidase, putative (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820553]; symbol=AT3G13510; hit=AT3G13510; species=arabidopsis; confidence=high
产物	carboxyl-terminal peptidase, putative (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820553]; symbol=AT3G13510; hit=AT3G13510; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G13510` (AT3G13510) carboxyl-terminal peptidase, putative (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820553] identity=73.3; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0573400` - identity=77.6; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03080 (Neprosin); PF14365 (Neprosin_AP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022175

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057807587.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057807587.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807587.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807587.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807587.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2288963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2288986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B120
`Chr4:2288992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B99,C67
`Chr4:2289299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B33,B50,B52,C1
`Chr4:2289688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B50,C35,C42
`Chr4:2289953`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A16,B113,B26,B27,B44,B7,C3
`Chr4:2290692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:2290734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B85
`Chr4:2290869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C32,C68
`Chr4:2290952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B122,B26,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807587.1

410 aa

205

410

Neprosin_AP

Neprosin

PF14365 Neprosin_AP 45-168 aa PF03080 Neprosin 192-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807587.1`	Pfam	`PF14365`	Neprosin_AP	Family	45	168	6.4e-48	162.9	Neprosin activation peptide
`XP_057807587.1`	Pfam	`PF03080`	Neprosin	Family	192	403	5.5e-86	288.1	Neprosin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951604.1
TAAAACGACGACGCTCTCATATTTCAATTCCTCTCTTTCCGTAGCTATGCTATATTGCTATTCCCCACATTTCCCCATTCTACCCCTCTCACGAGCTAAACAGCTCAAGCACTAGCGTCGGTAGGCGGCGGCAACCCCATATTGGATTTTTCCCAATTTTTCCCATTTTAAAAAATGCCACTTTTATTATAAATGTATTTTTGCAAAGCTGGGAAAGTGTTAACCACTTACTCCCTTGATAAGGACGAAAAGAAGGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022175
ATGGATATGAAGGTGAAACTGGTTGTCTGGTTTCTGTTCATGTTAACGGCGCCAGGTTTGGGGTCGGCGGCGCGGCGCCGGAATCTTGAGGTTAAGCGGCACCTCAGCCGTCTGAACAAGCCTTCTATCAAGTCCATCAAGAGCCCAGATGGTGATATCATAGACTGCATTCGCATATCTCATCAACCAGCTTTCGATCATCCCCATCTCAAGAATCACACAATTCAGATGATGCCTAGTTATCACCCAGAGGGGCTATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807587.1
MDMKVKLVVWFLFMLTAPGLGSAARRRNLEVKRHLSRLNKPSIKSIKSPDGDIIDCIRISHQPAFDHPHLKNHTIQMMPSYHPEGLYRDGKRVGKKESGGITQLWHKNGRCPQGTIPVRRTREDDLLRASSIQSFGKKKHKTIPKPPSYAAPQPDLINQNGHQHAIAYVEGDQYYGAKATINVWDPKIQQTNEFSLSQLWLLGGSFASDLNSIEAGWQVSPDLYGDNNTRLFTYWTSDAYQATGCYNLLCSGFIQINNQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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