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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000253`

染色体: Chr04 坐标: 2305033-2307170 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000253`
名称	SmilChr04G000253
描述	hypothetical protein At1g04090-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2305033 - 2307170 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022177`
GeneID	`131022177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022177`
原始查询	`SmilChr04G000253`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF946 family protein (DUF946) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819034]; symbol=AT2G44260; hit=AT2G44260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF946 family protein (DUF946) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819034]; symbol=AT2G44260; hit=AT2G44260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G44260` (AT2G44260) DUF946 family protein (DUF946) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819034] identity=58; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0575900` (OJ1562_B11.134) - identity=52.6; qcov=0.963; evalue=1.51e-176; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06101 (Vps62)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807588.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057807588.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057807588.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807588.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2305356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B55,C17,C43
`Chr4:2305590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:2305716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:2305832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:2305896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:2305902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B50,C52,C85
`Chr4:2306008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:2306096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C7
`Chr4:2306218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B33
`Chr4:2306385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:2306418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr4:2306689`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	72	A18,A2,A21,A23,A25,A3,A5,A7,A9,B104,B105,B107,B108,B11,B110,B115,B118,B119,B12,B13,B131,B132,B135,B136,B137,B138,B21,B22,B23,B24,B28,B29,B4,B40,B42,B5,B61,B63,B65,B67,B69,B7,B72,B73,B77,B8,B84,B87,B90,B92,B96,B98,C2,C24,C29,C3,C30,C33,C41,C48,C5,C51,C55,C59,C61,C63,C73,C77,C84,C87,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807588.1

541 aa

270

541

Vps62

PF06101 Vps62 22-539 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807588.1`	Pfam	`PF06101`	Vps62	Family	22	539	2.7e-231	769.3	Vacuolar protein sorting-associated protein 62

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951605.1
TTTTACTTGTATCTATATAAATCAAATATCCTCTTCTTTAAGCATAGGAAACTCAGTTAAAGCTTGTACGAAATCTAACTCAACCCCAAAAAGTGATCTTGCTTGGCCATTGGGTTTTTGTTTTCAAATATTCCATCGAAACATACCTCTCATATATGTCGTTCAATTTGTCTCTACATTGGTCCTAACATTATCCCAACTCTCCACACATTTTTTTTTATTTGTCTTTTTCCACAAAAAAAGTAAAAATAAAATAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022177
ATGGGGAGTGTATATCGCAAGATCTGTCGTATTTTCAAGAAAACAAAGAGGCCTCTTCCAATCGAAACCTCATTCGTGCTCCCATCTGCATTGCCGTCGTGGCCTGCAGGTGAGGGCTTCGCCACTGGGATTATCGATCTCGGCGGCTTGCAGATTCGTCAGGTCTCCACGTTCAACAGAATCTGGGCTGCGAGAGAAGGCGGCCCCGACAACCTCGGCGCCGCCTTCTTCGAGCCCTCCGCGCTTCCCGATGGCTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807588.1
MGSVYRKICRIFKKTKRPLPIETSFVLPSALPSWPAGEGFATGIIDLGGLQIRQVSTFNRIWAAREGGPDNLGAAFFEPSALPDGFFMLGGYSQPNNKPLSGWVLVAKDADGAALKPPTDYSLVWSSENLKMKQDGVGYIWSPTPPDGYRAVGSVVTSSPAKPALDAIRCVRVDLTDSVEAEDWIWGRSDGFSVYTSRPRNRGVEALGVPTNTFLAQNNGGDLGLVCLKNGNGKINGAMPNSDQIKALIQTYSPRLYFHP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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