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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000259`

染色体: Chr04 坐标: 2377729-2382158 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000259`
名称	SmilChr04G000259
描述	GTP-binding protein BRASSINAZOLE INSENSITIVE PALE GREEN 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2377729 - 2382158 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022182`
GeneID	`131022182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022182`
原始查询	`SmilChr04G000259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTP-binding protein BRASSINAZOLE INSENSITIVE PALE GREEN 2, chloroplastic
产物	GTP-binding protein BRASSINAZOLE INSENSITIVE PALE GREEN 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G10620` (AT4G10620) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826654] identity=53.4; qcov=0.646; evalue=4.62e-153; confidence=high
Rice	`Os06g0498900` - identity=58.8; qcov=0.923; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway); GO:1901259 (chloroplast rRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1); PF21516 (YqeH-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807598.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057807598.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057807598.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807598.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2378147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:2378186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B4,B6,C67
`Chr4:2378251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr4:2379861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:2379882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr4:2379895`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B6,C39
`Chr4:2379895`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B6,C39
`Chr4:2379972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C13,C37
`Chr4:2380059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B59,B9,C39,C75
`Chr4:2380094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B9,C11,C54,C69
`Chr4:2380185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr4:2380345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807598.1

652 aa

326

652

MMR_HSR1

YqeH-like_C

PF01926 MMR_HSR1 388-455 aa PF21516 YqeH-like_C 504-601 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807598.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	388	455	3.7e-09	37.4	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057807598.1`	Pfam	`PF21516`	YqeH-like_C	Domain	504	601	9.5e-10	39.6	YqeH-like, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951615.1
AAATAAAGTGAGTCTATACTTTTTGTTCTCCGATATATATATTTTTTTATATAATAAAATTCACTTCTGAAACATGAGTTTAAAGGTGAGTCGAAAACCAACCGGAATTGAATTGATCATTGTACCAATTGATTTTGATTTGGTCGAATTGAGGTAGACGAAAACGACCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAGAAAATATGTCTCGATTTTACATGATACTCTTCAGTCCACAAAATAGAATTTCATTCAAGGTAAACACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022182
ATGCTGTCAACCATCTCTCTATCTCTATCTTCAAGCGCTGTCAACCTATCGCTTGGAACAAAGCCTTCATCAAAATTCCAGCTTTTTACCGGATTGGATGTAGGGAGAAAGAAAGAAAAGAATTACAGTAAAGATTTATGTTTGGTACGGTGTAGTGAAGCAATTAGTCAGAAAGCTGAGAAAAGACGTGTGAGTAATTCAAGAAAAGGTGATAAAGGTGTAATTTTGAGTGAAGGGAGAGATGATGATCAGAATTTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807598.1
MLSTISLSLSSSAVNLSLGTKPSSKFQLFTGLDVGRKKEKNYSKDLCLVRCSEAISQKAEKRRVSNSRKGDKGVILSEGRDDDQNFGPICPGCGVFMQDRDPNFPGYFQKSEKIVKRSIETIEDLLDENFDEFEDDEDLSELEDLDDGDGDDDIKAELEKLDKDGSDWESDDWESELEDDEDEYLKELDGFTPAGVGYGNTTEETLEKRKRKKVSKAERKRISREAERETVEVTVCARCHSLRNYGRVKNQVAENLIPDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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