当前解析结果
SmilChr04G000261| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000261 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000261 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000261 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 2384197 - 2391461 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022185 |
|---|---|
| GeneID | 131022185 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022185 |
| 原始查询 | SmilChr04G000261 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022185 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807600.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807600.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807600.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057807600.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057807600.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:2389915 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C77 |
Chr4:2389919 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:2389971 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B49,C34,C79,D7 |
Chr4:2389973 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B59,B9,C75 |
Chr4:2389999 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,A9,B11,B66 |
Chr4:2390000 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr4:2390087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B39,B80 |
Chr4:2390092 |
CCT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | B12,B2,B4,B47,B64,B99,C19,C46,C56,C65,C71,C87,D3 |
Chr4:2390111 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr4:2390121 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B71,B98,C33,C62 |
Chr4:2390122 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr4:2390159 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 53 | A14,A16,A19,A2,A22,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B110,B113,B134,B137,B140,B18,B20,B21,B28,B33,B35,B43,B5,B59,B67,B79,B83,B85,B99,C11,C23,C24,C25,C32,C4,C40,C45,C5,C55,C57,C58,C61,C65,C67,C68,C7,C70,C79,C83,C86,C87,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。