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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000262`

染色体: Chr04 坐标: 2387446-2388214 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000262`
名称	SmilChr04G000262
描述	uncharacterized SmilChr04G000262
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2387446 - 2388214 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021125`
GeneID	`131021125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021125`
原始查询	`SmilChr04G000262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=28.6; qcov=0.642; evalue=2.57e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25; qcov=0.8; evalue=3.71e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806196.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806196.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057806196.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057806196.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2387449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B19,B89,C74
`Chr4:2387461`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	B105,B127,B134,B137,B14,B140,B16,B19,B24,B25,B33,B37,B41,B6,B63,B64,B83,B89,C2,C34,C38,C5,C61,C62,C73,C74,C9,D1,D4,D9
`Chr4:2387507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B114,B27,B39,C75
`Chr4:2387653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:2387678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B40,B66,B78,C20
`Chr4:2387697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B122,C73,C85
`Chr4:2387699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:2387702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C25
`Chr4:2387707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B13,B68,D1,D2
`Chr4:2387707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B68,D1,D2
`Chr4:2387712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:2387717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B111,C58,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806196.1

240 aa

120

240

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 42-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806196.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	42	136	6.3e-19	69.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950213.1
ATGCGGGAGGTGGGTCGGGGGGAGCTGGGAATGAGAACTGAAATGGAGAAGGGACCTCAGGGAAAGAGAGAGGGAGGCGGTAACAAAGATGGGTGGGAATGGACAGAGACAGCAGATGGCATTTACTCCACTAAATCTGCCTATGACGTCATCAAGTCAAGGAACATTGTGAATCCTCATCACACTGCCGACAAGCGGAGAATGGCGGAGGTTTGGAAGACGCCCGCACCCCATAAAGCCGCTGTTACAGCTTGGAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021125
ATGCGGGAGGTGGGTCGGGGGGAGCTGGGAATGAGAACTGAAATGGAGAAGGGACCTCAGGGAAAGAGAGAGGGAGGCGGTAACAAAGATGGGTGGGAATGGACAGAGACAGCAGATGGCATTTACTCCACTAAATCTGCCTATGACGTCATCAAGTCAAGGAACATTGTGAATCCTCATCACACTGCCGACAAGCGGAGAATGGCGGAGGTTTGGAAGACGCCCGCACCCCATAAAGCCGCTGTTACAGCTTGGAGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806196.1
MREVGRGELGMRTEMEKGPQGKREGGGNKDGWEWTETADGIYSTKSAYDVIKSRNIVNPHHTADKRRMAEVWKTPAPHKAAVTAWRLLRNRLPTCDNLEKRRVLLADEDKKCHQCNEHIETASHLFTSCTKTQEIWDEIQKWCGMCTARPPSTTMHWEMFGHCGRKKKIRKLLNMIWIGCVWMLWKKRNEKIFEGKESTVGEFIQEIKARTWGWNRTFGIVDVALNFVEWNSNELISRLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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