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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000263`

染色体: Chr04 坐标: 2390995-2396724 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000263`
名称	SmilChr04G000263
描述	protein ROS1A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2390995 - 2396724 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021126`
GeneID	`131021126`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021126`
原始查询	`SmilChr04G000263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ROS1A-like
产物	protein ROS1A-like
Arabidopsis	`AT2G36490` (DML1) demeter-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818224] identity=45.9; qcov=0.616; evalue=6.79e-147; confidence=high
Rice	`Os01g0218032` (ROS1A) - identity=46.1; qcov=0.662; evalue=1.77e-151; confidence=high
GO	GO:0006284 (base-excision repair); GO:0019104 (DNA N-glycosylase activity); GO:0035514 (DNA demethylase activity); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding); GO:0080111 (GO:0080111)
KEGG	-
Pfam	PF15628 (RRM_DME)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021126

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806197.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057806197.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806197.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806197.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2391018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:2391058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B98,C33,C62
`Chr4:2391085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B92,C50,C87
`Chr4:2391102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B25,B4,C76,D2
`Chr4:2391104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C28,C57,C61
`Chr4:2391108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B55,C10,C17,C43
`Chr4:2391134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C34,C79,D7
`Chr4:2391169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A11,B117,B132,B5,C32,C68,D10
`Chr4:2391209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B114
`Chr4:2391216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B59,B9,C39,C75
`Chr4:2391220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr4:2391220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806197.1

894 aa

447

894

RRM_DME

PF15628 RRM_DME 793-893 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806197.1`	Pfam	`PF15628`	RRM_DME	Family	793	893	2e-44	150.6	RRM in Demeter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950214.1
ATGTGCACACGCCATAAGAAGCCGCACAAGAGAAAGAAGATGAAGAGACACAACCCCAAAGTCGGTCCTATCACACCTTGCACTCCCAAACCTCGTACTCCAAAGCCCGCCAAGAAAGTGAAGAAGAAAAGTGTTGATTCCATCAATATTGATGCGAAAGCAACTATTAGTAAACGAGTGTGCAAACGTAAGTTGGATTTTGGTGAAGAATGTCCCGCCATGGGCCAAGAGGAGTTGATGAAGCCACAAGTTACGAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021126
ATGTGCACACGCCATAAGAAGCCGCACAAGAGAAAGAAGATGAAGAGACACAACCCCAAAGTCGGTCCTATCACACCTTGCACTCCCAAACCTCGTACTCCAAAGCCCGCCAAGAAAGTGAAGAAGAAAAGTGTTGATTCCATCAATATTGATGCGAAAGCAACTATTAGTAAACGAGTGTGCAAACGTAAGTTGGATTTTGGTGAAGAATGTCCCGCCATGGGCCAAGAGGAGTTGATGAAGCCACAAGTTACGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806197.1
MCTRHKKPHKRKKMKRHNPKVGPITPCTPKPRTPKPAKKVKKKSVDSINIDAKATISKRVCKRKLDFGEECPAMGQEELMKPQVTKDVPSEKVGPNTPKICKKRRWMRRTAKLNNLIRWIHEQLPATRTQVQEEEVDNTISRTQFQEDEVDNTISCNGSIRNGSILNAPVAKITDLQENVENVLLIQGDKDVRDALADFIVKKMQSLCINEECCDALVVAQKKYKGIVDLDQETMVVWNLLTRDDWNASAEAEALGADHE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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