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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000272`

染色体: Chr04 坐标: 2515457-2517243 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000272`
名称	SmilChr04G000272
描述	uncharacterized SmilChr04G000272
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2515457 - 2517243 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021129`
GeneID	`131021129`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021129`
原始查询	`SmilChr04G000272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=43.9; qcov=0.397; evalue=1.97e-54; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021129

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806201.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057806201.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806201.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806201.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806201.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2515543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr4:2515587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr4:2515610`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A1,A4,A7,A9,B119,B124,B127,B134,B15,B19,B20,B22,B31,B36,B37,B42,B43,B45,B53,B60,B66,B73,B76,B78,B79,B82,B91,C15,C17,C19,C2,C21,C27,C28,C30,C31,C33,C35,C41,C45,C46,C60,C65,C74,C78,C85,C86,C9,D1,D2,D9
`Chr4:2515875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:2515878`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	62	A2,A20,A21,A3,A7,B100,B103,B104,B108,B109,B111,B118,B123,B124,B128,B129,B131,B137,B140,B15,B2,B20,B23,B25,B36,B39,B43,B59,B6,B71,B72,B76,B8,B82,B84,B85,B88,B90,B92,B94,C12,C14,C15,C21,C25,C26,C27,C28,C40,C41,C44,C45,C52,C62,C63,C7,C81,C84,C87,D10,D2,D3
`Chr4:2515884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A2,A20,A21,A3,A7,B100,B103,B104,B107,B108,B109,B111,B118,B123,B124,B128,B129,B131,B137,B140,B15,B2,B20,B23,B25,B36,B39,B43,B44,B59,B6,B61,B71,B72,B76,B8,B82,B84,B85,B88,B90,B92,B94,C12,C14,C15,C21,C25,C26,C27,C28,C40,C41,C44,C45,C52,C62,C63,C7,C81,C84,C87,D10,D2,D3
`Chr4:2515885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	66	A2,A20,A21,A3,A7,B100,B103,B104,B107,B108,B109,B111,B118,B123,B124,B128,B129,B131,B137,B140,B15,B2,B20,B23,B25,B36,B39,B43,B44,B59,B6,B61,B71,B72,B76,B8,B82,B84,B85,B88,B90,B92,B94,C12,C14,C15,C21,C25,C26,C27,C28,C40,C41,C44,C45,C52,C62,C63,C7,C81,C84,C87,D10,D11,D2,D3
`Chr4:2515906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr4:2515925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B128,C1,C79
`Chr4:2515928`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A2,A3,B107,B108,B112,B118,B124,B20,B33,B71,C21,C45,C52,D10
`Chr4:2515983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:2516007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806201.1

499 aa

250

499

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 102-215 aa PF13952 DUF4216 385-441 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806201.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	102	215	2.4e-43	147.3	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057806201.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	385	441	2.2e-13	51.3	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950218.1
ATGTTTTGTCGCAGGCCCGAATTGGGAACGATTGATGCCTTGGGGCGGTATCCAAAGGCTTCTTACATGCTTGATAATGATGAGAAGAGAATCTTTTTGAAGTGGATAGAAGACCTCAAATTTCCTGATGACTATATATCGAATATGGCTAGGTGTGTTAACTTGAGCACTCTTCAAATGTTTGGGATGAAAAGCCATGATTGTCATGTTATGATGCAACGGATCTTGCCTGTTGCATTTAAGGAACTTCTTCCAAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021129
ATGTTTTGTCGCAGGCCCGAATTGGGAACGATTGATGCCTTGGGGCGGTATCCAAAGGCTTCTTACATGCTTGATAATGATGAGAAGAGAATCTTTTTGAAGTGGATAGAAGACCTCAAATTTCCTGATGACTATATATCGAATATGGCTAGGTGTGTTAACTTGAGCACTCTTCAAATGTTTGGGATGAAAAGCCATGATTGTCATGTTATGATGCAACGGATCTTGCCTGTTGCATTTAAGGAACTTCTTCCAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806201.1
MFCRRPELGTIDALGRYPKASYMLDNDEKRIFLKWIEDLKFPDDYISNMARCVNLSTLQMFGMKSHDCHVMMQRILPVAFKELLPNNVWKTITDLCFFFKELTSPNIQVDNLRQMQQNIPVILCKLKRIFSPSFFDSMEHLSIHLADEAMIAGPVQYRWMYPFERYLRKLKKTVKNKANVEGSITNAYLVEEATAFCSYYFEEHVRTKQRNIPRNFAGSSSSGGMEEHHDTLFVFKYAGRGFGKKSTRFLSKDEYDAAHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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