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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000277`

染色体: Chr04 坐标: 2540023-2543906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000277`
名称	SmilChr04G000277
描述	protein TIC 20-I, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2540023 - 2543906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022196`
GeneID	`131022196`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022196`
原始查询	`SmilChr04G000277`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 20-I, chloroplastic-like
产物	protein TIC 20-I%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G04940` (Tic20-I) translocon at the inner envelope membrane of chloroplasts 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839374] identity=72.9; qcov=0.942; evalue=1.57e-129; confidence=high
Rice	`Os07g0568500` (OJ1092_A07.131) - identity=48.1; qcov=0.682; evalue=1.63e-58; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16166 (TIC20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022196

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807615.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057807615.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807615.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807615.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807615.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2541662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:2543114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B137,B69
`Chr4:2543181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,C28,C9,D2
`Chr4:2543405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr4:2543420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:2543567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B77,D11
`Chr4:2543585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807615.1

274 aa

137

274

TIC20

PF16166 TIC20 94-267 aa

XP_057807616.1

274 aa

137

274

TIC20

PF16166 TIC20 94-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807615.1`	Pfam	`PF16166`	TIC20	Family	94	267	8.7e-73	244.7	Chloroplast import apparatus Tic20-like
`XP_057807616.1`	Pfam	`PF16166`	TIC20	Family	94	267	8.7e-73	244.7	Chloroplast import apparatus Tic20-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951633.1
AAAAAAAAATTCCTTCGACTACTACCCCCCTTCACGTCCCCTTACCCAATTTCCCAACTGCCGCCCCCTTCCCCATCCGAACCCCGCCGTCCCTCTGTTCCTACACTTAAGCTCGTCGACTTCAGTTCTGTGGAGGTCTTGAGTATTGCTGTGAAAACTAATGATACATAAAATTGGTGTTGGTGGCCACGGCAAAATCGGCAGTGCGAGGTCTAGGCGAGGAAGATTTTAGCTTTACCCACACCCCCTTATCCCTACTC...

XM_057951632.1
TCGACTACTACCCCCCTTCACGTCCCCTTACCCAATTTCCCAACTGCCGCCCCCTTCCCCATCCGAACCCCGCCGTCCCTCTGTTCCTACACTTAAGCTCGTCGACTTCAGTTCTGTGGAGGTCTTGAGTATTGCTGTGAAAACTAATGATACATAAAATTGGTGTTGGTGGCCACGGCAAAATCGGCAGTGCGAGGTCTAGGCGAGGAAGATTTTAGCTTTACCCACACCCCCTTATCCCTACTCTACTCCCAGCGTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022196
ATGAATCTTAGTGGGAGTTGTCTGAATTCTGGGGTTTCGAGTTTACTCCCTTACAACAGAAATCCATATACTCTCAGAACAAGTTCGAGAATTTCAAGCATTCAACCCGCACACAGAAACATTGAGTCTTTTAATTATAGAAGCTCCAGGCGACCTCTTCCTGAAATTAAATCATCGGCATCTTTAGGCATCCAGCACTTGTGTCTTTCTGCTGCATCATCACCACTCTTACATGGAGAACAAGGGAGTTTGTTTCATAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807615.1
MNLSGSCLNSGVSSLLPYNRNPYTLRTSSRISSIQPAHRNIESFNYRSSRRPLPEIKSSASLGIQHLCLSAASSPLLHGEQGSLFHTIPKFPTRHRQSLAARASKDVPSSYRYPAMTKKPRWWWRTLACLPYLMPLHETWMYAETAYHLHPFLEDFEFVTYPFLGALGRLPSWFLMAYFFVAYLGVVRRKEWPHFFRFHVVMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKVGMHFWTAMAFAYLFTVLECIRCALAGMYSDV...

XP_057807616.1
MNLSGSCLNSGVSSLLPYNRNPYTLRTSSRISSIQPAHRNIESFNYRSSRRPLPEIKSSASLGIQHLCLSAASSPLLHGEQGSLFHTIPKFPTRHRQSLAARASKDVPSSYRYPAMTKKPRWWWRTLACLPYLMPLHETWMYAETAYHLHPFLEDFEFVTYPFLGALGRLPSWFLMAYFFVAYLGVVRRKEWPHFFRFHVVMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKVGMHFWTAMAFAYLFTVLECIRCALAGMYSDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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