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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000282`

染色体: Chr04 坐标: 2586921-2587785 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000282`
名称	SmilChr04G000282
描述	protein CHROMATIN REMODELING 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2586921 - 2587785 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021131`
GeneID	`131021131`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021131`
原始查询	`SmilChr04G000282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHROMATIN REMODELING 5-like
产物	protein CHROMATIN REMODELING 5-like
Arabidopsis	`AT2G13370` (CHR5) chromatin remodeling 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815823] identity=86.8; qcov=0.984; evalue=8.85e-66; confidence=high
Rice	`Os06g0255200` (P0592E11.17-2) - identity=51; qcov=0.813; evalue=6.5e-30; confidence=medium
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0003677 (DNA binding); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0034728 (nucleosome organization); GO:0042393 (histone binding); GO:0140658 (ATP-dependent chromatin remodeler activity)
KEGG	-
Pfam	PF00176 (SNF2-rel_dom); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021131

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057806203.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057806203.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806203.1`
4	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057806203.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806203.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2587297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B122,B2,B91
`Chr4:2587297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B2,B91
`Chr4:2587303`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A5,B82,D5
`Chr4:2587303`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A5,B82,D5
`Chr4:2587316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C30
`Chr4:2587316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr4:2587327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr4:2587333`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C33
`Chr4:2587333`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C33
`Chr4:2587349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C46
`Chr4:2587500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C33
`Chr4:2587515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806203.1

123 aa

123

ResIII

SNF2-rel_dom

PF04851 ResIII 32-112 aa PF00176 SNF2-rel_dom 36-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806203.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	32	112	5.6e-07	30.3	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057806203.1`	Pfam	`PF00176`	SNF2-rel_dom	Domain	36	120	1.8e-28	100.2	SNF2-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950220.1
CCTGGCTTGGCCTTTGTTGCTTTTTGGCCCACAAGAACTAAGATTTTCAATTGATTTTGTAAAGGATATATTGTAGTTTAATGTTATGTACGTTAGTTTATCAATGCCATGACCCCTTCATGATTGCAGTCTCGAGAGGCCGCGTCAATGGTTCCAGGGAAGACTGTTGATTTTCAGCGCAAGAAAATCAAAGGAAGTCTCAGGAAGCTTGACGAGCAGCCTGAGTGGCTGAAAGGGGGCAAACTTCGAGACTATCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021131
ATGGTTCCAGGGAAGACTGTTGATTTTCAGCGCAAGAAAATCAAAGGAAGTCTCAGGAAGCTTGACGAGCAGCCTGAGTGGCTGAAAGGGGGCAAACTTCGAGACTATCAGCTTGAAGGTCTTAACTTTCTTGTTAACAGCTGGAGAAATGATACCAATGTAATTTTAGCTGATGAAATGGGTCTTGGTAAAACTGTTCAGTCAGTTTCAATGCTTGGTTTTCTGCAGAATTCTCAGCAAATTCAAGGACCATTTCTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806203.1
MVPGKTVDFQRKKIKGSLRKLDEQPEWLKGGKLRDYQLEGLNFLVNSWRNDTNVILADEMGLGKTVQSVSMLGFLQNSQQIQGPFLVVVPLSTLSNWAKEFRKWLPEMNVIIYVGTRASREVG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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