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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000323`

染色体: Chr04 坐标: 2935453-2936807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000323`
名称	SmilChr04G000323
描述	cyclin-D3-1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2935453 - 2936807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022262`
GeneID	`131022262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022262`
原始查询	`SmilChr04G000323`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-D3-1-like
产物	cyclin-D3-1-like
Arabidopsis	`AT4G34160` (CYCD3;1) CYCLIN D3;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829564] identity=56.1; qcov=0.993; evalue=3.6e-47; confidence=medium
Rice	`Os09g0466100` (CycD2) - identity=58.6; qcov=0.5; evalue=1.41e-20; confidence=low
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF02984 (Cyclin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807718.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807718.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807718.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807718.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807718.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2936049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A18,B113,B125,B131,B38,B39,B90,B92,C49,C87,D9
`Chr4:2936061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B13,B2,B3,C85
`Chr4:2936271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B107,C10,C42,C87
`Chr4:2936283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A23,A24,B128,B51,B60,B69,B88,C30,D10
`Chr4:2936311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A11,A15,A20,A5,B101,B110,B115,B117,B124,B125,B129,B130,B14,B23,B26,B29,B31,B34,B41,B46,B53,B57,B62,B68,B71,B78,B79,B88,B9,B93,C32,C36,C48,C55,C58,C61,C68,C70,C74,C77,C80,C84,D3,D5
`Chr4:2936360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B115,B23,B31,C36,D3
`Chr4:2936360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B23,B31,C36,D3
`Chr4:2936381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B107,C10,C42,C87
`Chr4:2936390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B69,C11,C69
`Chr4:2936396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B2,B3,B76,C85
`Chr4:2936410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B13,B2,B3,C85
`Chr4:2936528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B119,B140,B15,B5,B65,B74,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807718.1

140 aa

140

Cyclin_N

Cyclin_C

PF00134 Cyclin_N 2-57 aa PF02984 Cyclin_C 60-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807718.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	2	57	2.8e-08	34.3	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057807718.1`	Pfam	`PF02984`	Cyclin_C	Domain	60	135	7.8e-09	36.3	Cyclin, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951735.1
CACTGTTCCTCAAAGGAAACAGATGCGGGGGTCACCCTCAGTTTGTGAAGCTCGAAGCTACAACAATCCTTGTTAATTTTTTTGTTTACACAATTGCCCCCAATTTCCATCGCCACCACCACCCTACACGCTGCCTTAGCCGTGAACTATTACGACATATTTGTCACCAGCCGCTGCTTTTAGAGGGAGAAGCCATGGATGAATCAGTTGGTTGCCGTCGCGTTTCTCTGTGTAGCTGCCAAAGTGGAAAAGACTGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022262
ATGAATCAGTTGGTTGCCGTCGCGTTTCTCTGTGTAGCTGCCAAAGTGGAAAAGACTGAAGTGTCGCTTTTGTTAGATTTGCAAGTTGAGGAATCTAAATATCTGTTCGAGGCAAAGACGATTCAGAGAATGGAGCTTCTCCTACTCTTTACGGTCGAATGGAGGATGAATCCGATGACGTCGATGTCCTTCTTCGACCACATTGCGAGGCGATTTGAGTTCGTGAAGAATCTACATTGGGAATTTTTAAGGAGATGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807718.1
MNQLVAVAFLCVAAKVEKTEVSLLLDLQVEESKYLFEAKTIQRMELLLLFTVEWRMNPMTSMSFFDHIARRFEFVKNLHWEFLRRCEGVILSAIADSRLVHYLPSAIAAATMIYAVRDIGDEDAAEYEDQLLLVLRASKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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