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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000325`

染色体: Chr04 坐标: 3004912-3005598 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000325`
名称	SmilChr04G000325
描述	uncharacterized SmilChr04G000325
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3004912 - 3005598 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021145`
GeneID	`131021145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021145`
原始查询	`SmilChr04G000325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=28.1; qcov=0.61; evalue=1.45e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25; qcov=0.825; evalue=1.47e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806219.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057806219.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806219.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806219.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3004942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	64	A1,A10,A23,A4,A6,B100,B101,B106,B113,B117,B12,B124,B125,B130,B131,B134,B140,B16,B21,B26,B30,B31,B34,B38,B39,B40,B46,B49,B50,B52,B54,B56,B58,B6,B64,B67,B69,B70,B77,B84,B96,C10,C15,C16,C18,C2,C20,C27,C28,C29,C33,C40,C44,C45,C5,C54,C63,C7,C71,C76,C8,C80,D4,D7
`Chr4:3004958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:3004983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr4:3004983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:3005015`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B131
`Chr4:3005015`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B131
`Chr4:3005017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C87
`Chr4:3005020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C8
`Chr4:3005021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C87
`Chr4:3005036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr4:3005056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B48,C87
`Chr4:3005132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806219.1

228 aa

114

228

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 32-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806219.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	32	124	4.6e-15	56.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950236.1
ATGTGGGAGGCTTTGAGGATTTTAATTTCTCAAGTTATTCCTTGTGCAGGTAAGGAAGATGTTTGGAGCTGGAAATCTGGAAAAGACGACGTCTTCTCAACAAAGGCGGCATATGATATCATCGCGGCCTCTAACTACGGGCTGCCCCCGGTGGAGGAGGTTGAGGCTGCAAAAGTTTGGAAGGCTCGGGCACCCCATAAGGCAACAGTTTCGGCTTGGCGAGCTTTGATCAATCGATTGTCCACTTGTGATAACTTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021145
ATGTGGGAGGCTTTGAGGATTTTAATTTCTCAAGTTATTCCTTGTGCAGGTAAGGAAGATGTTTGGAGCTGGAAATCTGGAAAAGACGACGTCTTCTCAACAAAGGCGGCATATGATATCATCGCGGCCTCTAACTACGGGCTGCCCCCGGTGGAGGAGGTTGAGGCTGCAAAAGTTTGGAAGGCTCGGGCACCCCATAAGGCAACAGTTTCGGCTTGGCGAGCTTTGATCAATCGATTGTCCACTTGTGATAACTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806219.1
MWEALRILISQVIPCAGKEDVWSWKSGKDDVFSTKAAYDIIAASNYGLPPVEEVEAAKVWKARAPHKATVSAWRALINRLSTCDNLLRRNVYLGVEERWCNSCVMQDETAEHIFLHCPKVEMVWNQIHQWIDVKTAKPKGILQHFKSFVLGVRRKEGRKLLLALWVGIIWLIWMYRNESRFEGRVWDANQLVLEMKGRLWSWNKIFHLVDENGSFSSWCSSEHKLSFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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