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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000326`

染色体: Chr04 坐标: 3006243-3007817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000326`
名称	SmilChr04G000326
描述	DNA damage-repair/toleration protein DRT100-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3006243 - 3007817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022233`
GeneID	`131022233`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022233`
原始查询	`SmilChr04G000326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA damage-repair/toleration protein DRT100-like
产物	DNA damage-repair/toleration protein DRT100-like
Arabidopsis	`AT3G20820` (AT3G20820) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821630] identity=67.2; qcov=0.956; evalue=2.74e-174; confidence=high
Rice	`Os08g0505900` (PGIP6) - identity=62.2; qcov=0.953; evalue=6.41e-157; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022233

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057807679.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057807679.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807679.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807679.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3006517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B69
`Chr4:3006679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:3006799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:3006964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:3007115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:3007279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B52,C30,C37,C76
`Chr4:3007438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807679.1

364 aa

182

364

LRRNT_2

LRR_14

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 23-62 aa PF23598 LRR_14 97-203 aa PF00560 LRR_1 129-151 aa PF00560 LRR_1 153-175 aa PF00560 LRR_1 178-199 aa PF00560 LRR_1 226-247 aa PF00560 LRR_1 301-318 aa PF00560 LRR_1 324-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	23	62	3.1e-13	50.5	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	97	203	9.4e-15	54.9	Leucine-rich repeat region
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	129	151	2.5e-29	95.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	153	175	2.5e-29	95.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	178	199	2.5e-29	95.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	226	247	2.5e-29	95.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	301	318	2.5e-29	95.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057807679.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	324	338	2.5e-29	95.7	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951696.1
TGTTTCATCAACTGTCGAAACATAAACATAAGCCCTTTCCCAACCGTAATTCTCCCATCTTCCCAGGGGCATTTTCGTCCCATCACCCTCTTATATAACCTTATGCTATCAGCCATCGTCCCTCCTCCACTCCACACTCCACCCTCTCTCTCACACACTTTCCCGCTCTGAGATCACACACTCTCACCGACATTGTCTCAAAACCACGTCCATACAGTTCAGCAATGACATCTCTCGCCACAGTAGCAGCGCTGCTCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022233
ATGACATCTCTCGCCACAGTAGCAGCGCTGCTCTTAGCCGTGGCTGTGGCGGCGAACGCCTGCGCGCCGGCTGACCGGGAAGCCCTGCTAGCGTTCAAAGCTGCCCTAAGCGAGCCATATTTAGGCATATTCAAGTCATGGTCTGGCAGCGACTGCTGCACCAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACCCGGATTCCAAACGCGTCGCCGACATCGTCCTCCGCGGCGAGTCCGAGGACCCTATCTTCGAGAAAGCCGGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807679.1
MTSLATVAALLLAVAVAANACAPADREALLAFKAALSEPYLGIFKSWSGSDCCTNWYGVSCDPDSKRVADIVLRGESEDPIFEKAGRSGYMTGSISPALCRLDRLTTLVLADWKGISGQIPPCITSLPNLRILDLIGNKITGQIPADIGKLSRLTVLNVADNQISGALPSSIVNLNRLMHLELSNNQISGEIPSDIGKLSMMSRALLSRNRLTGPIPTSLASIYRLADLDLSMNQISGSIPGQLGSMPVLSTLNLDGNLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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