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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000330`

染色体: Chr04 坐标: 3036384-3039766 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000330`
名称	SmilChr04G000330
描述	uncharacterized SmilChr04G000330
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3036384 - 3039766 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022238`
GeneID	`131022238`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022238`
原始查询	`SmilChr04G000330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=23.2; qcov=0.579; evalue=3.34e-06; confidence=weak
Rice	`Os09g0480300` - identity=40.2; qcov=0.566; evalue=2.71e-39; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022238

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807688.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807688.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807688.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807688.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3036563`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B100,B132,C9
`Chr4:3036563`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B100,B132,C9
`Chr4:3036598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B58,C78,D11
`Chr4:3036610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr4:3036628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B118
`Chr4:3036632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B23,B72
`Chr4:3036632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B72
`Chr4:3036643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B72
`Chr4:3036674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B23
`Chr4:3036681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:3036698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	116	A10,A13,A15,A19,A21,A25,A3,A8,B1,B10,B104,B105,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B128,B129,B131,B132,B135,B136,B137,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B32,B34,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B49,B52,B53,B56,B58,B69,B7,B73,B75,B79,B82,B84,B85,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C17,C18,C20,C22,C23,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C33,C34,C36,C38,C40,C44,C46,C48,C50,C52,C53,C54,C55,C6,C60,C62,C65,C75,C76,C79,C86,C87,C9,D1,D2,D4,D6,D8
`Chr4:3036714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101186.1
GTTTTATTTAGGTTTAATTATAGTTTATAGCCTCAACTTTTAACTTTTTTTATTTTATAGCCTTAACTATGATTTATTTTTTGTATATCAAGAACTTTGGTATATTATTTAATTATAGCCCGAAAATAAAAGTCAGTATCGGAAATATGATCTGGATAGCCGGTAATCTGACTCAGATTACAAAAAAAATGAGGTGGACATTTTAATTTTATTTTTAGGCCACATCATCAAATAACAAAATAAAAAACAATGGAATTGTC...

XM_057951705.1
GTTTTATTTAGGTTTAATTATAGTTTATAGCCTCAACTTTTAACTTTTTTTATTTTATAGCCTTAACTATGATTTATTTTTTGTATATCAAGAACTTTGGTATATTATTTAATTATAGCCCGAAAATAAAAGTCAGTATCGGAAATATGATCTGGATAGCCGGTAATCTGACTCAGATTACAAAAAAAATGAGGTGGACATTTTAATTTTATTTTTAGGCCACATCATCAAATAACAAAATAAAAAACAATGGAATTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022238
ATGTTGGAAGATATTAGGCAGTCTCTTATGGTGAGAATGCATGACATTGTTAAAAAATTAGAAGTGTGCAAGGATGAGATCTGTCCAAATATCAGAAAAAGACTGAATAAGATAGATAGCCTAACTAGATTTTGTGAAATCTTGCCGGGTGTTGGAGGAAAGTATGAGGTCAAGCACCTCAATGTGACATATATTGTGGATCTAGGTGCTGGATTGTGTTCTTGTGTAGATTGGAATCTTACAGCCATTCCTTGTGTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807688.1
MLEDIRQSLMVRMHDIVKKLEVCKDEICPNIRKRLNKIDSLTRFCEILPGVGGKYEVKHLNVTYIVDLGAGLCSCVDWNLTAIPCVHAMACINHSRVHVENFVDPFYFKTTCQAAYKFCLEPSLGESEWPKINECPIQPPYVCKLPGRPKKNRKRAEDELRMHSSNKITKHGVKMKCSMCGGVGHNKRSCLIAKSAAIGSEVLEQPCNASTSELRKHKRQAREGFGVLVAESGNILWRNPSGGRAQLVVTSRHPNDCVQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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