当前解析结果
SmilChr04G000347| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000347 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000347 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000347 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 3258530 - 3258973 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021151 |
|---|---|
| GeneID | 131021151 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021151 |
| 原始查询 | SmilChr04G000347 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021151 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057806224.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057806224.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057806224.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806224.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806224.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:3258533 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,B138,B85,C64 |
Chr4:3258549 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B66,B84 |
Chr4:3258586 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B120,C10,C28,C32,C68 |
Chr4:3258588 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B138,B85 |
Chr4:3258629 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 60 | A13,A15,A2,A20,A21,A7,B1,B10,B102,B11,B110,B119,B12,B134,B135,B139,B16,B18,B19,B21,B23,B24,B25,B33,B4,B43,B51,B52,B53,B55,B57,B64,B67,B82,B90,B97,B99,C16,C17,C23,C25,C29,C3,C30,C37,C39,C41,C43,C47,C50,C52,C57,C63,C64,C67,C7,C75,C81,C84,D7 |
Chr4:3258891 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B17,B24,B70,C46 |
Chr4:3258892 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B17,B70,C46 |
Chr4:3258902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,D8 |
Chr4:3258946 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,C22,C48 |
Chr4:3258958 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,C22 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。