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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000349`

染色体: Chr04 坐标: 3270501-3272207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000349`
名称	SmilChr04G000349
描述	extensin-2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3270501 - 3272207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022229`
GeneID	`131022229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022229`
原始查询	`SmilChr04G000349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	extensin-2-like
产物	extensin-2-like
Arabidopsis	`AT4G08370` (AT4G08370) Proline-rich extensin-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826393] identity=55.4; qcov=0.581; evalue=9.99e-13; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005199 (structural constituent of cell wall); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF04554 (Extensin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057807674.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057807674.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807674.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807674.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807674.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3270960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,B91,D7
`Chr4:3270961`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B7,B91,D7
`Chr4:3270961`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B7,B91,D7
`Chr4:3270994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr4:3271045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:3271085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B128
`Chr4:3271105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:3271126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:3271141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C42
`Chr4:3271229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:3271426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A5,C32,C47,C80
`Chr4:3271515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,C8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807674.1

413 aa

206

413

Extensin_2

PF04554 Extensin_2 330-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807674.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	330	372	2.4e-31	108.3	Extensin-like region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951691.1
GACTAGTTCAACAATGGTTGGCATTGATTTGCTATATAAAGTGTATATGATTAGTTTTCAAAATATCAAGACAGTAGTAAAAAACTTGAGGTGTTTAAAGGAGTAGAAAACGAAAACTTACATCAGCAGCAGTCATGTGGAGCTATGGCGGATCCCAGCTGGGGATCCTGTTAGCTCTCTTCACCATACTTGCTGCATCTGCAAATGCCTTCCCATCACTGAAATTTTGGGTCCCTGACTCCAATTATTCTCCACCACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022229
ATGTGGAGCTATGGCGGATCCCAGCTGGGGATCCTGTTAGCTCTCTTCACCATACTTGCTGCATCTGCAAATGCCTTCCCATCACTGAAATTTTGGGTCCCTGACTCCAATTATTCTCCACCACCTTCGTCCTACAGTTATGAATCACCTCCACCGTACAAATATGAATCGCCACCTCCACCACCATATAAGTACAAGTCTCCACCACCACCCCCGTACAAATACGAGTCTCCACCACCTCCGCCGTACAAGTACGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807674.1
MWSYGGSQLGILLALFTILAASANAFPSLKFWVPDSNYSPPPSSYSYESPPPYKYESPPPPPYKYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPPYKYESPPPPPYKYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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