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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000370`

染色体: Chr04 坐标: 3715311-3719135 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000370`
名称	SmilChr04G000370
描述	cytochrome c-type biogenesis protein CcmE homolog, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3715311 - 3719135 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022244`
GeneID	`131022244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022244`
原始查询	`SmilChr04G000370`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c-type biogenesis protein CcmE homolog, mitochondrial-like
产物	cytochrome c-type biogenesis protein CcmE homolog%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G51790` (G1) transmembrane protein G1P-related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824342] identity=59.4; qcov=0.851; evalue=3.66e-91; confidence=high
Rice	`Os10g0545800` - identity=55.6; qcov=0.819; evalue=2.49e-81; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0017003 (protein-heme linkage); GO:0017004 (cytochrome complex assembly); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF03100 (CcmE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807694.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057807694.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057807694.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807694.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3715665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:3715972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:3716026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:3716231`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B117
`Chr4:3716231`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807694.1

281 aa

140

281

CcmE

PF03100 CcmE 119-245 aa

XP_057807695.1

281 aa

140

281

CcmE

PF03100 CcmE 119-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807694.1`	Pfam	`PF03100`	CcmE	Domain	119	245	7.3e-26	91.1	CcmE domain
`XP_057807695.1`	Pfam	`PF03100`	CcmE	Domain	119	245	7.3e-26	91.1	CcmE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101187.1
CTCAAATATTGCAATTTTAGATTTTGACCCCACAAAAGCAATTAAAACCCATAAAACTCCCTTAAACCCTTCCACAATTTCCCCCAATCCAATGGCACCCAGATTCCCCACGCGCCTCCTTCTCCGCCACGTCCTCCGCCGCCAAAACCAGTCGCCGCCCGTTCCCTCCCGCCACCACTCCACCGCCGCCCTCATACCTAAACCCCACCCCTTCACACAACCCCTCTTCAATCCTCACGGATCCCCCACCATATTCAACC...

XR_009101189.1
CTCAAATATTGCAATTTTAGATTTTGACCCCACAAAAGCAATTAAAACCCATAAAACTCCCTTAAACCCTTCCACAATTTCCCCCAATCCAATGGCACCCAGATTCCCCACGCGCCTCCTTCTCCGCCACGTCCTCCGCCGCCAAAACCAGTCGCCGCCCGTTCCCTCCCGCCACCACTCCACCGCCGCCCTCATACCTAAACCCCACCCCTTCACACAACCCCTCTTCAATCCTCACGGATCCCCCACCATATTCAACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022244
ATGGCACCCAGATTCCCCACGCGCCTCCTTCTCCGCCACGTCCTCCGCCGCCAAAACCAGTCGCCGCCCGTTCCCTCCCGCCACCACTCCACCGCCGCCCTCATACCTAAACCCCACCCCTTCACACAACCCCTCTTCAATCCTCACGGATCCCCCACCATATTCAACCACCCCCAACACCCAATTCTCCGGTTCCAATCGACCCGGCCCGGCCGCTCTACCCGATCCAAAAAGCCCGACATCGCAGCCCGCGCCCGGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807694.1
MAPRFPTRLLLRHVLRRQNQSPPVPSRHHSTAALIPKPHPFTQPLFNPHGSPTIFNHPQHPILRFQSTRPGRSTRSKKPDIAARARQLQTRRLWTYALTISCIAGFIVIVLNQFQDQLVFYVTPTEALDKYTSDPKKSKFRLGGLVLENSVAQIPSSPEIQFVITDLITDILVKYEGSLPDLFREGHSAVVEGFIKPLDEETKKKEEALLKSTSKLGVTEKARTLECYFAATEVLAKHDEKYMPAEVANAIEKNKKFIEG...

XP_057807695.1
MAPRFPTRLLLRHVLRRQNQSPPVPSRHHSTAALIPKPHPFTQPLFNPHGSPTIFNHPQHPILRFQSTRPGRSTRSKKPDIAARARQLQTRRLWTYALTISCIAGFIVIVLNQFQDQLVFYVTPTEALDKYTSDPKKSKFRLGGLVLENSVAQIPSSPEIQFVITDLITDILVKYEGSLPDLFREGHSAVVEGFIKPLDEETKKKEEALLKSTSKLGVTEKARTLECYFAATEVLAKHDEKYMPAEVANAIEKNKKFIEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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