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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000384`

染色体: Chr04 坐标: 3909915-3911564 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000384`
名称	SmilChr04G000384
描述	uncharacterized SmilChr04G000384
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3909915 - 3911564 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021168`
GeneID	`131021168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021168`
原始查询	`SmilChr04G000384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=26.7; qcov=0.368; evalue=7.05e-21; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806240.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057806240.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057806240.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057806240.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057806240.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3909916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:3909945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:3909958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B50,C42
`Chr4:3909960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A20,A24,A7,A8,B109,B48,B53,B59,C57,D10
`Chr4:3909992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:3910002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A8,B89,B94,C55
`Chr4:3910007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C62
`Chr4:3910031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B50,C86,D11
`Chr4:3910031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C86,D11
`Chr4:3910062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:3910078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A21,C42,C48,C83
`Chr4:3910087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806240.1

549 aa

274

549

DUF4283

PF14111 DUF4283 118-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806240.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	118	203	5.7e-07	29.9	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950257.1
ATGGATTCCGGCCATTCGCCTCGTAATGGCCATGACCGTTCGGCTCTAAACCTTCCTGCTATATCGAACAACTTCACGCCTCACTCGGCTGCAACACCATCTTCTCCAGTAAACCCTAAAAATAAAGATAGCCTGGGTATCAAACCTAATCAGTCGGATGCTGCCACCGCCGAAACCACCGGTCCGTCTTCGCCGAAGAACACCCCTACTGCTCTTAACTATGCGGCTGCTGTGAGACCGCGTCAAAGGAAGCCGGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021168
ATGGATTCCGGCCATTCGCCTCGTAATGGCCATGACCGTTCGGCTCTAAACCTTCCTGCTATATCGAACAACTTCACGCCTCACTCGGCTGCAACACCATCTTCTCCAGTAAACCCTAAAAATAAAGATAGCCTGGGTATCAAACCTAATCAGTCGGATGCTGCCACCGCCGAAACCACCGGTCCGTCTTCGCCGAAGAACACCCCTACTGCTCTTAACTATGCGGCTGCTGTGAGACCGCGTCAAAGGAAGCCGGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806240.1
MDSGHSPRNGHDRSALNLPAISNNFTPHSAATPSSPVNPKNKDSLGIKPNQSDAATAETTGPSSPKNTPTALNYAAAVRPRQRKPDLPAHRFQALHASSLSGVDTLSIPLEFYKERIADFKHALIGRLMLRKGTKPKLVHELKGELQNIWKISNSWQLISMGKGFFTLKFSSLEDKKTAKGKLNLDLSQGQLRLREWVPKFDPYKEFSSMAQVWVRIYYLPIELWHPEVISAIGRYLGNPIHIDGGSADRDVGHYARVLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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