当前解析结果
SmilChr04G000390| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000390 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000390 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000390 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 3964837 - 3972397 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022249 |
|---|---|
| GeneID | 131022249 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022249 |
| 原始查询 | SmilChr04G000390 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | delta-latroinsectotoxin-Lt1a protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819996]; symbol=AT3G08490; hit=AT3G08490; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | delta-latroinsectotoxin-Lt1a protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819996]; symbol=AT3G08490; hit=AT3G08490; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G08490 (AT3G08490)delta-latroinsectotoxin-Lt1a protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819996] identity=40.4; qcov=0.951; evalue=1.33e-65; confidence=medium |
| Rice | Os03g0216500- identity=38.9; qcov=0.909; evalue=2.23e-56; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022249 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057807702.1 |
| 2 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.60000 | XP_057807702.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.40000 | XP_057807702.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057807702.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807702.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:3964926 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr4:3965146 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr4:3971671 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A22,C21 |
Chr4:3971943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。