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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000393`

染色体: Chr04 坐标: 4010273-4015739 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000393`
名称	SmilChr04G000393
描述	protein DETOXIFICATION 43
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4010273 - 4015739 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022221`
GeneID	`131022221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022221`
原始查询	`SmilChr04G000393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DETOXIFICATION 43
产物	protein DETOXIFICATION 43
Arabidopsis	`AT3G08040` (FRD3) MATE efflux family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819995] identity=65.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0216700` (OsFRDL1) - identity=63.1; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015137 (citrate transmembrane transporter activity); GO:0015297 (antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0042910 (xenobiotic transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01554 (MatE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057807652.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057807652.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057807652.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807652.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4012250`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A1
`Chr4:4012250`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A1
`Chr4:4012523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B58,C35,C49,D6
`Chr4:4012631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B59,C86
`Chr4:4012669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B54
`Chr4:4012773`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B1,B111,B120,B128,B62,B91,C71
`Chr4:4014056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:4014646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:4014835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr4:4014860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B7,B96
`Chr4:4014888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B6
`Chr4:4015082`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807652.1

542 aa

271

542

MatE

PF01554 MatE 189-281 aa PF01554 MatE 342-492 aa

XP_057807653.1

522 aa

261

522

MatE

PF01554 MatE 169-261 aa PF01554 MatE 322-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807652.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	189	281	1.8e-27	96.7	MatE
`XP_057807652.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	342	492	1.8e-27	96.7	MatE
`XP_057807653.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	169	261	1.4e-27	97.1	MatE
`XP_057807653.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	322	472	1.4e-27	97.1	MatE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951670.1
AAACCAAACTCGACACCAAAAGCATTTACACTTCTTAACTTGAGAGAGAGAGAGAGGTGATCTGCAGCATTGATACAGCTAATTTACTGGTCTCATCAAATTCAAGTTTGGAAGCTCAATGGGTGATGAGAATAATGCTGAGGTGTCAGCTGCCGGAAAGTGGAAGTTCCCGGTGTTTGTCTTCTTCCAAGATGCTAGGAATGTTTTGAAGAGGGATGAGCTAGGGCGGGAGATACTGCGCATCGCGTTCCCGGCGGCGC...

XM_057951669.1
GAAGGCTCTTGCATCTCCTTTCCTTAACAATTAAATAATTCATGGAGAAATTACCTTGTCATTGCTAGCTACCTCCAATTATCACACAAATTAAGGTGGTGATCGATGTCTATATATGCTCATGCTAGGAATAATTCATATGAATTAATTGCAGTTGGAAGCTCAATGGGTGATGAGAATAATGCTGAGGTGTCAGCTGCCGGAAAGTGGAAGTTCCCGGTGTTTGTCTTCTTCCAAGATGCTAGGAATGTTTTGAAGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022221
ATGTCTATATATGCTCATGCTAGGAATAATTCATATGAATTAATTGCAGTTGGAAGCTCAATGGGTGATGAGAATAATGCTGAGGTGTCAGCTGCCGGAAAGTGGAAGTTCCCGGTGTTTGTCTTCTTCCAAGATGCTAGGAATGTTTTGAAGAGGGATGAGCTAGGGCGGGAGATACTGCGCATCGCGTTCCCGGCGGCGCTGGCGCTGGCCGCCGATCCCATCGCATCTTTGATCGATACGGCGTTTATCGGGCACTT...

LOC131022221
ATGGGTGATGAGAATAATGCTGAGGTGTCAGCTGCCGGAAAGTGGAAGTTCCCGGTGTTTGTCTTCTTCCAAGATGCTAGGAATGTTTTGAAGAGGGATGAGCTAGGGCGGGAGATACTGCGCATCGCGTTCCCGGCGGCGCTGGCGCTGGCCGCCGATCCCATCGCATCTTTGATCGATACGGCGTTTATCGGGCACTTAGGGGCGGTGGAAATCGGAGCTGTAGGAGTTTCCATTGCTATCTTCAACCAAGCCTCCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807652.1
MSIYAHARNNSYELIAVGSSMGDENNAEVSAAGKWKFPVFVFFQDARNVLKRDELGREILRIAFPAALALAADPIASLIDTAFIGHLGAVEIGAVGVSIAIFNQASKVTIFPLVSITTSFVAQEDTVNRISDAHDLEKPPSDNNDNNNNNNSSSTTNIAIIDEKSNNINPHEGKGSKWKWESERRNIPSASTALVLGVVLGLIQTIFLVFLAKPLLNLMGVKTGSPMLEPAERYLTIRSLGAPAVLLSLAMQGIFRGFKD...

XP_057807653.1
MGDENNAEVSAAGKWKFPVFVFFQDARNVLKRDELGREILRIAFPAALALAADPIASLIDTAFIGHLGAVEIGAVGVSIAIFNQASKVTIFPLVSITTSFVAQEDTVNRISDAHDLEKPPSDNNDNNNNNNSSSTTNIAIIDEKSNNINPHEGKGSKWKWESERRNIPSASTALVLGVVLGLIQTIFLVFLAKPLLNLMGVKTGSPMLEPAERYLTIRSLGAPAVLLSLAMQGIFRGFKDTKTPLYAIVVGDLTNIILDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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