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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000400`

染色体: Chr04 坐标: 4136911-4137958 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000400`
名称	SmilChr04G000400
描述	uncharacterized SmilChr04G000400
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4136911 - 4137958 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022872`
GeneID	`131022872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022872`
原始查询	`SmilChr04G000400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsPBF1; symbol=OsPBF1; hit=Os09g0505600; species=rice; confidence=medium
产物	OsPBF1; symbol=OsPBF1; hit=Os09g0505600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G60820` (PBF1) N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825253] identity=77.5; qcov=0.459; evalue=5.55e-55; confidence=medium
Rice	`Os09g0505600` (OsPBF1) - identity=77.5; qcov=0.459; evalue=3.88e-55; confidence=medium
GO	GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00227 (Proteasome)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808402.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808402.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808402.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808402.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808402.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4137490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B112
`Chr4:4137490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:4137618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:4137650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:4137670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr4:4137692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:4137699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B45,B52,B65,D6
`Chr4:4137717`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr4:4137717`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr4:4137721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:4137749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C42
`Chr4:4137760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808402.1

222 aa

111

222

Proteasome

PF00227 Proteasome 121-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808402.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	121	207	8.6e-07	29.5	Proteasome subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952419.1
CTCGGTCTTCTCACTCCCCGCGCCGCACCTCCATCTCTGCCATCCCTAGACTCACTCCCATCTCCCTCAGTCGGCGTGCCTCACCTCCATCGCCGGTCGTCTTCTCCGATTCGCTCGCCCGCCCGCCGCTGGAGTCACGCTCGCCGCTCGATCCCTGCTTCGCTCGGCCTCTCTGCCTCGCTCCCTGCTTCTCTCCCTCCATCGCCCGCCGCTGGAGTCACGCCGCGCTCGCTCGCCCGCCAGCAGCAGCGGCAGTGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022872
CTCGGTCTTCTCACTCCCCGCGCCGCACCTCCATCTCTGCCATCCCTAGACTCACTCCCATCTCCCTCAGTCGGCGTGCCTCACCTCCATCGCCGGTCGTCTTCTCCGATTCGCTCGCCCGCCCGCCGCTGGAGTCACGCTCGCCGCTCGATCCCTGCTTCGCTCGGCCTCTCTGCCTCGCTCCCTGCTTCTCTCCCTCCATCGCCCGCCGCTGGAGTCACGCCGCGCTCGCTCGCCCGCCAGCAGCAGCGGCAGTGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808402.1
LGLLTPRAAPPSLPSLDSLPSPSVGVPHLHRRSSSPIRSPARRWSHARRSIPASLGLSASLPASLPPSPAAGVTPRSLARQQQRQCSTLQFVQLQPPSFQFGSPHSTASLLIFSCLLKFIEGKGCVFTYDAVGSYERVGYSAQGSGATLITPFLDNQLKSPSPLLLPAKDAVTPLSEVEAIDLVKTCFVSATERDIYTGDEVEMLVVNASGLRREFMDLRKD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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