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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000425`

染色体: Chr04 坐标: 4509853-4511933 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000425`
名称	SmilChr04G000425
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4509853 - 4511933 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022312`
GeneID	`131022312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022312`
原始查询	`SmilChr04G000425`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
产物	protein DUF642 L-GALACTONO-1%2C4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
Arabidopsis	`AT3G08030` (AT3G08030) DNA-directed RNA polymerase subunit beta (Protein of unknown function, DUF642) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819994] identity=73.8; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0807700` - identity=67.1; qcov=0.948; evalue=1.44e-169; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04862 (DUF642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057807741.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057807741.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057807741.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807741.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807741.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4510063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B42,B43,B58
`Chr4:4510143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B42,B43,B58
`Chr4:4510204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C54
`Chr4:4510223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C54
`Chr4:4510309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr4:4510458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C54
`Chr4:4511112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:4511129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C54
`Chr4:4511189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B12
`Chr4:4511243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C35,C58
`Chr4:4511354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:4511380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807741.1

362 aa

181

362

DUF642

PF04862 DUF642 23-179 aa PF04862 DUF642 191-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807741.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	23	179	3.3e-84	281.1	Protein of unknown function (DUF642)
`XP_057807741.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	191	357	3.3e-84	281.1	Protein of unknown function (DUF642)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951758.1
AAGGAGAAAAAGGTAAAGTGATATCCACCTTTTGAAATTTCTTGAATTATCAACCTGCTGCTGCTTCAATCTTCTGTCTCTTCCTCCACCTCCCACATGCTTTATTTTCACACTCACTCACTCACAACACTCTATATAAATACCCCTCCCTCACCTCTACTCAACTGAAGCCCTAGAAATGGCGCTGAAGACTACTGTCTTTCTCTCTCTCTCCTTTCTCTACACAGTTTCTGCTTCTTTCGAAGGGCTGCTTCCCAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022312
ATGGCGCTGAAGACTACTGTCTTTCTCTCTCTCTCCTTTCTCTACACAGTTTCTGCTTCTTTCGAAGGGCTGCTTCCCAATGGAAACTTCGAGGAGACCCCGAAGAGCACAGACATGAAGAAAACGGTGCTCCAGGGGCGTCACGCCCTCCCCAAATGGGAGATCAGCGGCCTGGTCGAGTACATTTCCGGCGGGCCCCAGCCGGGGGGGATGTACTTCGCGGTGGCGCACGGCGTCCACGCGGTGCGCCTCGGCAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807741.1
MALKTTVFLSLSFLYTVSASFEGLLPNGNFEETPKSTDMKKTVLQGRHALPKWEISGLVEYISGGPQPGGMYFAVAHGVHAVRLGNEASVSQPIPVRNGSLYALTFGASRTCAQNEVLRVSVPPQSGDLPLQTLYSSNGGDTYAWGFRATSSSVKVVFHNPGMQEDPACGPLLDAVAIKELTLPTATKANLVKNGGFEEGPHILLNSSHGVLLPPKQEDSTSPLPGWIIESLKAVKFIDSNHFNVPSGKSAVELVAGRES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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