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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000435`

染色体: Chr04 坐标: 4611475-4613615 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000435`
名称	SmilChr04G000435
描述	uncharacterized SmilChr04G000435
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4611475 - 4613615 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022882`
GeneID	`131022882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022882`
原始查询	`SmilChr04G000435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0499600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0499600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G15020` (AT4G15020) hAT transposon superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827161] identity=34.5; qcov=0.881; evalue=6.41e-93; confidence=low
Rice	`Os09g0499600` - identity=33.6; qcov=0.861; evalue=6e-97; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808409.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808409.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808409.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808409.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808409.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4611503`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B104,B113,B27,B58
`Chr4:4611503`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B104,B113,B27,B58
`Chr4:4611550`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A7,A8,B19,B30,B5,C30,C58,C76,C78,D4
`Chr4:4611669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,D11
`Chr4:4611674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:4611712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B30
`Chr4:4611766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B32,B86
`Chr4:4611778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B46,B82,C59
`Chr4:4611782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A21,B112,B117,B120,B123,B131,B133,B20,B28,B4,B48,B56,B58,B60,B63,B7,B78,B95,B96,C24,C3,C32,C42,C52,C57,C65,C68,C74,C82
`Chr4:4611783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A21,B112,B117,B120,B123,B131,B133,B20,B28,B4,B48,B56,B58,B60,B63,B7,B78,B95,B96,C24,C3,C32,C42,C52,C57,C65,C68,C74,C82
`Chr4:4611793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C14
`Chr4:4611794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808409.1

632 aa

316

632

DUF659

Dimer_Tnp_hAT

PF04937 DUF659 114-260 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 462-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808409.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	114	260	1.2e-55	188.0	Domain of unknown function (DUF659)
`XP_057808409.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	462	524	1.7e-08	34.8	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952426.1
ATGAAGGAATATTTGAGAGCATTTGAGGAATCAAAACACACCAAACAACGAGAATTCGATGATGCAGTTGATGGTGGGGCCTATTTTGGTGTTGATCTGCCGTTCCCAGCCAGCGTGAAGAGAGGTATCAGAGGCCCTATGGATCGATTTGTTGCTAATGAGTTAGAAGATGGCAAAGTAGTCCCTCCAAGTGCAACGGCTAAAGAGCACTGTAGTCGAGTTTGTCTAGATATTGGGAGGTTCTTCTTTGAGAACTCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022882
ATGAAGGAATATTTGAGAGCATTTGAGGAATCAAAACACACCAAACAACGAGAATTCGATGATGCAGTTGATGGTGGGGCCTATTTTGGTGTTGATCTGCCGTTCCCAGCCAGCGTGAAGAGAGGTATCAGAGGCCCTATGGATCGATTTGTTGCTAATGAGTTAGAAGATGGCAAAGTAGTCCCTCCAAGTGCAACGGCTAAAGAGCACTGTAGTCGAGTTTGTCTAGATATTGGGAGGTTCTTCTTTGAGAACTCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808409.1
MKEYLRAFEESKHTKQREFDDAVDGGAYFGVDLPFPASVKRGIRGPMDRFVANELEDGKVVPPSATAKEHCSRVCLDIGRFFFENSIPFNCVRSPSFISMVRSIGGYGRGLKPPSMHEMRTWILKEEVKTTSAIVDEIKATWKHTGVSLLSDGWSDMRNRSLINFLVNNQYGTMFLKTVDASDVVKNAQKLFELLDEVVEEIGEDHVVQVITDNVVAYKAAGRLLMEKRTSLYWTPCAAHCIDLMLEKIVDFELNKKVAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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