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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000437`

染色体: Chr04 坐标: 4628034-4669251 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000437`
名称	SmilChr04G000437
描述	probable glycosyltransferase STELLO1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4628034 - 4669251 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022324`
GeneID	`131022324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022324`
原始查询	`SmilChr04G000437`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glycosyltransferase STELLO1
产物	probable glycosyltransferase STELLO1
Arabidopsis	`AT2G41770` (AT2G41770) transmembrane protein, putative (DUF288) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818776] identity=64.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0656400` - identity=56.2; qcov=0.834; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03385 (STELLO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057807756.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057807756.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807756.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807756.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4628210`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr4:4628210`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr4:4628428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B113,B127,B37,B75,C21,C27,C36,C65
`Chr4:4628599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B40,B56,B7,B96
`Chr4:4628605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C49
`Chr4:4628878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A20,B40,B56,B7,B96
`Chr4:4628878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B40,B56,B7,B96
`Chr4:4629101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:4629107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,D11
`Chr4:4629288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:4629356`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B2,B76
`Chr4:4629356`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B2,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807756.1

610 aa

305

610

STELLO

PF03385 STELLO 353-476 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807756.1`	Pfam	`PF03385`	STELLO	Family	353	476	2.9e-13	50.1	STELLO glycosyltransferases

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951773.1
TCCTCTTCATGATCACTTGCTGCCAATTGTTGTTGCAGCTCAAGCTCCAAAACCTACATCCTACACCAATTCACCACTTCACTCTGCGCGTGTGTGTGTGTGAGAAAAAAAGAAAGAATTACAGTGGTTGAATTGAATCCTCATAACTGATATTAATCAAATGATCGTCCAAGATCACCCCTCCACTAAATCCTCAAAACCCCATTATTACCCTCTCAATCTCAAAACTTCCAACAAAATCCCACTCTTCTCCCATACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022324
ATGATCGTCCAAGATCACCCCTCCACTAAATCCTCAAAACCCCATTATTACCCTCTCAATCTCAAAACTTCCAACAAAATCCCACTCTTCTCCCATACCAAAAGTCTCGATTTCTCCACATGGGCTTCCGACAACTCCTTCAAATTGTTCATAATCACCATCTTCACCTTCACAGTTGCAGCATTTTTCTTCTTCTTCCACACCTCCACTCCCCTCTTCTGCTCCCAGAATTCCCAAATTCCGCACAAACTCAAAATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807756.1
MIVQDHPSTKSSKPHYYPLNLKTSNKIPLFSHTKSLDFSTWASDNSFKLFIITIFTFTVAAFFFFFHTSTPLFCSQNSQIPHKLKIPKPNFNSIHPILDKSSPYSSFHSELWIIVSVSDYPSIPLQNLVRTKGWQVLAVGNSKTPKDWSLKGAIFLSLDQQADLGFRVVDYLPYDSYVRKSVGYLFAIQHGAKRIFDADDRGEVIGGDLGKHFDLDLGSAVVKQQRILQYSDGNSNRTVVNPYVHFGQRSVWPRGLPLEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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