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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000440`

染色体: Chr04 坐标: 4667808-4669683 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000440`
名称	SmilChr04G000440
描述	thioredoxin-like protein Clot
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4667808 - 4669683 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022326`
GeneID	`131022326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022326`
原始查询	`SmilChr04G000440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin-like protein Clot
产物	thioredoxin-like protein Clot
Arabidopsis	`AT5G42850` (AT5G42850) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834296] identity=62.5; qcov=0.909; evalue=3.98e-53; confidence=high
Rice	`Os06g0320000` - identity=55.1; qcov=1.03; evalue=1.05e-51; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0047134 (protein-disulfide reductase [NAD(P)H] activity)
KEGG	-
Pfam	PF06110 (TXD17-like_Trx)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807760.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057807760.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807760.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807760.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4668029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B23
`Chr4:4668150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr4:4668173`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	5	A20,B23,B46,C53,C62
`Chr4:4668173`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A20,B23,B46,C53,C62
`Chr4:4668215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807760.1

132 aa

132

TXD17-like_Trx

PF06110 TXD17-like_Trx 19-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807760.1`	Pfam	`PF06110`	TXD17-like_Trx	Domain	19	130	1.6e-36	125.2	Thioredoxin domain-containing protein 17-like, thioredoxin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951777.1
TTTGACAGATGTTTTTTCCATTATCGTTTTTATCTTTGATTGCGTAATGTGCACGAGTAGTTTGGCGGCATTTAAAGCCTAAATATTCATTTTCAATTTGCAGGAGCAGAGGGCAAAGAAATGCCGATGAAGGCGTTGGAAGCAACATTGTCGACATTTGATGGCGTGTTTCAGCAATTTACGGCTGAAGCCGCCAATAACAAGGCGAATTTTATCCTTTTCTTGGCTGACAACGAACCGTCCACCAATCTTAGTTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022326
ATGCCGATGAAGGCGTTGGAAGCAACATTGTCGACATTTGATGGCGTGTTTCAGCAATTTACGGCTGAAGCCGCCAATAACAAGGCGAATTTTATCCTTTTCTTGGCTGACAACGAACCGTCCACCAATCTTAGTTGGTGCCCTGATTGTGTTAGAGCTGAACCAGTGATATACAAGAAGCTAGAAGCGGCTTCAGGTAATGTGGCATTGTTGAAGGCCTACGTTGGAGATAGGCCTACATGGAGGAACCCTCAGCACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807760.1
MPMKALEATLSTFDGVFQQFTAEAANNKANFILFLADNEPSTNLSWCPDCVRAEPVIYKKLEAASGNVALLKAYVGDRPTWRNPQHPWRVDPRFKLTGVPTLIRWENGSVKARLEDHEAHLERKIDTLVSED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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