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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000450`

染色体: Chr04 坐标: 4769472-4771648 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000450`
名称	SmilChr04G000450
描述	uncharacterized SmilChr04G000450
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4769472 - 4771648 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022884`
GeneID	`131022884`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022884`
原始查询	`SmilChr04G000450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=38.5; qcov=0.086; evalue=1.74e-06; confidence=weak
Rice	`Os12g0142900` - identity=34.9; qcov=0.573; evalue=7.52e-55; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF03732 (PEG10_N-capsid); PF08284 (RVP_2); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022884

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808412.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808412.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808412.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808412.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4769574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B98,C26
`Chr4:4769601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C15,C26
`Chr4:4769613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B119,B40,C12
`Chr4:4769622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C15,C6
`Chr4:4769670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr4:4769724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C26
`Chr4:4769742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B66,B67,C64
`Chr4:4769882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B15,B2,B82,D7
`Chr4:4769890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B46,B93,C10,C13
`Chr4:4769970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B71,C6
`Chr4:4769982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B72,B79,C17,C69,D2
`Chr4:4769996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808412.1

606 aa

303

606

PEG10_N-capsid

Ty3_capsid

RVP_2

RVT_1

PF03732 PEG10_N-capsid 3-81 aa PF19259 Ty3_capsid 7-160 aa PF08284 RVP_2 271-334 aa PF00078 RVT_1 518-588 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808412.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	3	81	3.5e-09	37.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057808412.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	7	160	9.2e-08	32.4	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057808412.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	271	334	1.8e-14	54.4	Retroviral aspartyl protease
`XP_057808412.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	518	588	8e-18	65.8	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952429.1
ATGGCACCACCGACGTTGAAAGGAAACGAGGGACCTTTGGGGACTGAAGAGTGGATACGTCAGATGGAATGCATTTTCAACTACATGCGTTGTAGAGATGACTCGAAGGTGACATGTGCGGCCTTCCAACTTATAGATGATGCAGGGCATTGGTGGGAGTCAGAAACTGCTGCCCTTACTGAGGAGCAGGTGAGAGCCATCAGCTGGCGGACATTCAAGGAGAGAGTGATGGGGAAGTATTTCCCAAAGGCTTTTCGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022884
ATGGCACCACCGACGTTGAAAGGAAACGAGGGACCTTTGGGGACTGAAGAGTGGATACGTCAGATGGAATGCATTTTCAACTACATGCGTTGTAGAGATGACTCGAAGGTGACATGTGCGGCCTTCCAACTTATAGATGATGCAGGGCATTGGTGGGAGTCAGAAACTGCTGCCCTTACTGAGGAGCAGGTGAGAGCCATCAGCTGGCGGACATTCAAGGAGAGAGTGATGGGGAAGTATTTCCCAAAGGCTTTTCGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808412.1
MAPPTLKGNEGPLGTEEWIRQMECIFNYMRCRDDSKVTCAAFQLIDDAGHWWESETAALTEEQVRAISWRTFKERVMGKYFPKAFRKQKEIELMNLKQGNLTVLEYERKFTQLARFTPHLVDTDEKKAWRFENGLRPEIGGHLAALNITSYSEILERAQAVASRLKLDNSIARPQHTGGKRQWDDRDKKRSNQPEKKPRSNMGDNQGFMPNKPLCPRCQRHHFGECRYGENNKNNNWGMNQGNNNNNNDARRGEARVYAM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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