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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000451`

染色体: Chr04 坐标: 4786540-4800066 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000451`
名称	SmilChr04G000451
描述	structural maintenance of chromosomes protein 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4786540 - 4800066 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022334`
GeneID	`131022334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022334`
原始查询	`SmilChr04G000451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes protein 5
产物	structural maintenance of chromosomes protein 5
Arabidopsis	`AT5G15920` (SMC5) structural maintenance of chromosomes 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831449] identity=62.7; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0596600` (SMC5) - identity=57.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0030915 (Smc5-Smc6 complex)
KEGG	-
Pfam	PF02463 (SMC_N); PF13476 (AAA_23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807772.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057807772.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057807772.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057807772.1`
5	PML body	PML body	0.80000	`XP_057807772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4789687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C28
`Chr4:4789786`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr4:4789786`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr4:4797807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B59
`Chr4:4798317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:4799550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807772.1

1052 aa

526

1052

SMC_N

AAA_23

PF02463 SMC_N 24-992 aa PF13476 AAA_23 26-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807772.1`	Pfam	`PF02463`	SMC_N	Domain	24	992	1.2e-15	58.3	RecF/RecN/SMC N terminal domain
`XP_057807772.1`	Pfam	`PF13476`	AAA_23	Domain	26	240	7.7e-19	69.9	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951789.1
ATGAGCCTACGCCAAGAATATTGGGAGCAAATCTATCCTCTTCCAAACTTCCGTCCCCATCTACTCACACACGTGCGGAAATCAATATGTAGACTCCATCGCACGTGCTTCTCTGTTGGCGCCAATTCTCCCACACTCTCTCTTACTGTATAGCCTGCGGGGCTGCTCAACTTGTAAAATTTTCTCTTTCATCTTAAAACACGCACTACACATAGTAGAAGCCCTAGTTCTCACACTTTGATTTCAAAAGGTATTCGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022334
ATGGCGGACGAGCCAACGCCCAAGAGGCCCAAAATTTCCAGGGGGGATGATGATTATGTCCCAGGAAATATAATCAAAATTGAGATCTGCAACTTCATGACCTTCAGTAAACTGACCTGCAAGCCTGGTTCACGCTTAAATTTGGTTATTGGGCCAAATGGCTCTGGAAAGAGTTCTCTTGTATGTGCCATTGCACTTGGACTTGGAGGTGAACCACAGCTTCTTGGAAGGGCTAAGAAAATTGGTGCGTATGTGAAACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807772.1
MADEPTPKRPKISRGDDDYVPGNIIKIEICNFMTFSKLTCKPGSRLNLVIGPNGSGKSSLVCAIALGLGGEPQLLGRAKKIGAYVKRGEESGYTEICLRGESKQEQITITRKIDINHKSEWLFNGKVVGRKVISEVIARFNIQVDNLTQFLPQDRVCEFAKLTPVQLLVETEKAVGDPRLPVLHTNLIKKSTELKKFERAVESNRGSLNQLTAQNAELERDVERVRQREDLLAKAESMKKKLPWLKYDMKKATYQEAKKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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